中国8个黄牛品种线粒体DNA遗传多样性研究
本研究从我国山东省、四川省、海南省、广东省、福建省、江西省及黑龙江省采集鲁西牛(SJ)、渤海黑牛(SW)、宣汉牛(XH)、海南黄牛(HN)、徐闻黄牛(LZ)、闽南牛(MN)、赣南黄牛(T)与延边牛(YB)共8个品种的33个样品，利用PCR技术，自行设计一对特异性引物，用ClustalW(1.82)软件对8个黄牛品种33个个体的线粒体DNAD-loop区910bp全序列进行同源序列比对与分析，实验取得如下结果：
1.检测到中国8个黄牛品种33个个体有21种单倍型；在这21种单倍型D-loop区全序列中，碱基T平均占28.5﹪，C占24.9﹪，G占13.6﹪，A占33.0﹪。A+T平均含量为61.5﹪，G+C平均含量为38.5﹪，说明中国黄牛D-loop全序列富含A+T碱基。
2.检测到21种单倍型有核苷酸多态位点71个，约占所测核苷酸总长的7.80﹪，其中有61个转换，7个颠换，3个转换/颠换共存。
3.中国8个黄牛品种mtDNAD-loop区核苷酸多样度(π值)为0.00﹪～3.23﹪，单倍型多样度(H)为0.00～1.00，8个黄牛群体D-loop的核苷酸多样度(π值)分2个层次，海南牛、徐闻牛、赣南牛及延边牛的核苷酸多样度(π值)最低，分别为0、0.22﹪、0.15﹪和0.77﹪；闽南牛、渤海黑牛、鲁西牛和宣汉牛的苷酸多样度(π值)很高，别为2.53﹪、2.88﹪、3.03﹪和3.23﹪。表明中国8个黄牛品种mtDNA遗传多样性比较丰富。
4.根据单倍型构建了中国8个黄牛品种的NJ分子系统树。聚类表明，中国黄牛有普通牛和瘤牛2大母系起源。延边牛、渤海黑牛(SW10、SW15)、宣汉牛(XH6、XH9)、鲁西牛(SJ8、SJ27)，它们与普通牛(ST)聚在一起，说明它们起源于普通牛；宣汉牛(XH7)、徐闻牛(LZ16)、鲁西牛(SJ5、SJ12、SJ19)、赣南黄牛(T11、T23)、海南牛(HN1)、闽南牛(MN4、MN5)，它们与瘤牛(L27732)聚在一起，说明它们起源于瘤牛。
5.并探讨了用核苷酸多样度π值的大小来衡量黄牛群体遗传分化程度的可行性。欧洲牛、非洲牛和印度瘤牛都分别是单一起源，故其π值较低；中国北方黄牛如延边牛是普通牛起源；南方黄牛如海南牛、徐闻牛和赣南牛是瘤牛起源，故其π值相对较低。
中国;黄牛群体;品种;线粒体;遗传多样性;核苷酸;多样度;单倍型;延边牛;母系起源;普通牛;鲁西牛;渤海黑牛;海南;全序列;平均含量;赣南;闽南;特异性引物;分子系统树
西北农林科技大学
硕士
遗传学
陈宏;雷初朝
2005
中文
Q343.35
48
2005-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）