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引言
1．SARS-CoV-2基因组组成
2．SARS-CoV-2基因组突变特征
3．SARS-CoV-2感染诱导的免疫反应特征
4．SARS-CoV-2感染的临床表征
二、类器官及其在病毒感染机制研究中的应用
三、单细胞转录组测序技术在新冠病毒感染机制研究中的应用
1．发现新型细胞类型
2．发现单个细胞类型的炎症反应特征
3．揭示新的免疫调节通路
4．发现合并感染的微生物
5．鉴定新的生物标识
前言
一、材料
1．类器官和病毒
2．实验试剂
3．类器官的培养
4．引物合成
5．仪器设备
二、实验与分析方法
1．病毒培养
2．病毒核酸提取
4．病毒基因组文库构建及谱系鉴定
5．构建类器官病毒感染模型
6．病理切片制作
7．免疫组化分析
8．心脏及肠道类器官细胞消化
9．类器官核酸提取
10病毒基因组RNA绝对定量分析
11．制备单细胞
12．单个细胞分离制备
13．cDNA扩增
14．单细胞样本3’端基因表达文库构建
15．深度测序
16．单细胞转录组数据分析
第一章心脏类器官新冠病毒感染模型单细胞转录组特征
一、结果
1．心脏类器官感染模型的构建
2．心脏类器官单细胞转录组测序
3．心脏类器官感染模型细胞组成及SARS-CoV-2复制特征
4．心脏类器官RNA速率分析探究细胞间转化
5．心脏类器官单细胞转录组特征
6．SARS-CoV-2感染后心脏类器官细胞间相互作用
二、讨论
第二章肠道类器官新冠病毒感染模型单细胞转录组特征
一、结果
1．肠道类器官疾病模型的构建
2．肠道类器官单细胞转录组测序
3．肠道类器官感染模型细胞组成及SARS-CoV-2复制特征
4．肠道类器官RNA速率分析探究细胞间转化
5．肠道类器官单细胞转录组特征
6．SARS-CoV-2感染后肠道类器官细胞间相互作用特征
二、讨论
总结
参考文献
博士在学期间已发表学术论文
个人简历
致谢