三种鲍线粒体基因测序及系统发育分析
线粒体16S rRNA、COⅠ、COⅡ基因是物种线粒体基因研究中比较普遍的基因序列，在群体遗传结构，种系发生及亲缘关系研究等方面应用广泛，是比较忠实的遗传分子标记。本文选取中国的皱纹盘鲍（H.discus hannai），澳大利亚的黑唇鲍(H.rubra)和新西兰的黑足鲍(H.iris)3种典型经济鲍作为研究对象，通过测定其线粒体16S rRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段，来分析其单核苷酸多态性及种内种间一致性和系统发育关系，为鲍的新品种引进、杂交育苗提供理论支持。 本研究主要获得以下结果: (1)三种鲍线粒体16S rRNA基因片段测序及系统发育分析 采用基因测序方法，对皱纹盘鲍(H.hannai)、黑足鲍(H.iris)和黑唇鲍(H.rubra)线粒体16S rRNA基因序列片段进行PCR扩增和测序。试验得到的序列长度分别为皱纹盘鲍544bp，黑唇鲍550bp，黑足鲍546bp; A+T碱基含量比例分别为皱纹盘鲍58.1％，黑唇鲍56.2％，黑足鲍56.4％;种内一致性分别为皱纹盘鲍96.37％，黑唇鲍97.51％，黑足鲍99.06％。三种鲍的种间一致性为93.94％。皱纹盘鲍的碱基突变率为0.37％，黑足鲍的碱基突变率为0.55％，黑唇鲍的碱基突变率为0.36％。黑足鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.148，皱纹盘鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.116，皱纹盘鲍与黑足鲍间的遗传距离为0.077。 (2)三种鲍线粒体COⅠ基因片段测序及系统发育研究分析 采用基因测序方法，对皱纹盘鲍(H..hannai)、黑足鲍（H.iris）和黑唇鲍(H.rubra)线粒体COⅠ基因序列片段进行PCR扩增和测序。实验得到的序列长度分别为皱纹盘鲍554bp，黑唇鲍573bp，黑足鲍552bp; A+T碱基含量比例分别为皱纹盘鲍55.4％，黑唇鲍52.3％，黑足鲍53.5％;种内一致性分别为皱纹盘鲍97.66％，黑唇鲍98.49％，黑足鲍97.42％。三种鲍的种间一致性为89.12％。皱纹盘鲍的碱基突变率为0.36％，黑足鲍的碱基突变率为0.36％，黑唇鲍的碱基突变率为2.09％。黑足鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.204，皱纹盘鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.200，皱纹盘鲍与黑足鲍间的遗传距离为0.186。 (3)种鲍线粒体COⅡ基因片段测序及系统发育研究分析 采用基因测序方法，对皱纹盘鲍(H..hannai)、黑足鲍（H.iris）和黑唇鲍(H.rubra)线粒体COⅡ基因序列片段进行PCR扩增和测序。实验得到的序列长度分别为皱纹盘鲍151bp，黑唇鲍150bp，黑足鲍153bp; A+T碱基含量比例分别为皱纹盘鲍58.3％，黑唇鲍53.7％，黑足鲍56.5％;种内一致性分别为皱纹盘鲍98.23％，黑唇鲍99.33％，黑足鲍91.83％。三种鲍的种间一致性为92.51％。皱纹盘鲍的碱基突变率为3.31％，黑足鲍的碱基突变率为19.61％，黑唇鲍的碱基突变率为2.00％。黑足鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.124，皱纹盘鲍与黑唇鲍间的遗传距离为0.192，皱纹盘鲍与黑足鲍间的遗传距离为0.071。 以上结果表明:线粒体16S rRNA、COⅠ、COⅡ基因序列片段适用于鲍种间遗传分析、系统发生及亲缘关系研究。数据表明线粒体16S rRNA序列最为保守，COⅡ基因序列碱基突变率最高。皱纹盘鲍与黑足鲍间的亲缘关系最近。属于同一地理种群的鲍亲缘关系较近。
皱纹盘鲍;黑唇鲍;黑足鲍;单核苷酸多态性;系统发育
山东大学
硕士
海洋生物学
侯旭光
2017
中文
S968.315
76
2017-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）