河南省3种鲈形目鱼类自然居群的遗传多样性分析
本研究以河南省鲈形目Perciformes鱼类中乌鳢（Channa argus）、鳜鱼（Sinipercachuatsi）和斑鳜（Siniperca scherzeri）的自然居群为研究对象，利用ISSR分子标记技术对其遗传多样性和遗传结构进行分析，旨在为河南省鲈形目鱼类种质资源评价、保护、遗传育种和可持续利用提供理论依据。主要结果如下: (1)利用正交设计试验方法，建立3种鱼的ISSR-PCR最佳反应体系。其中乌鳢的最佳反应体系:25μl反应体系中含60ng模板DNA，2.5mmol/L Mg2+，0.3μmol/L引物，0.2mmol/L dNTPs，0.5U Taq DNA聚合酶;鳜鱼和斑鳜的最佳反应体系:25μl反应体系中含80 ng模板DNA，2mmol/L Mg2+，0.4μmol/L引物，0.2mmol/L dNTPs，0.75U Taq DNA聚合酶。在此基础上确立了乌鳢、鳜鱼和斑鳜的ISSR-PCR的最佳扩增条件。 (2)筛选出15个ISSR引物对丹江口水库、淇河和南湾水库3个乌鳢自然居群的基因组DNA进行ISSR-PCR扩增，共检测到141个位点，多态位点53个，多态性比例为37.59％;利用POPGENE软件分析其遗传多样性指标，其多态位点比例(PPB)分别为19.86％、25.53％和29.79％，观测等位基因数(Na)分别为1.1986、1.2553和1.2979，有效等位基因数(Ne)分别为1.1239、1.1745和1.1976，Nei's基因多样度（h）分别为0.0712、0.0976和0.1123，Shannon's信息指数(I)分别为0.1057、0.1428和0.1653，平均遗传距离(D)分别为0.0628、0.0800和0.1016。上述结果表明，河南省乌鳢居群的遗传多样性保持在一定水平，3居群的遗传多样性水平依次为南湾水库居群＞淇河居群＞丹江口水库居群。基于Shannon's信息指数分析乌鳢居群的变异来源，23.14％存在于居群间，76.86％变异来源于居群内;基于Nei's基因多样性数据计算的居群间遗传分化系数Gst为0.1984，居群间基因流Nm为2.0199，基因流水平较高。说明乌鳢居群间在自然选择的作用下发生了较大的遗传分化，其遗传分化主要来自于居群内。 (3)用15个ISSR引物对南湾水库和丹江口水库2个鳜鱼自然居群的基因组DNA进行ISSR-PCR扩增，共检测到148个位点，多态位点79个，多态性比例为53.38％;2个鳜鱼居群内的PPB值分别为28.38％和27.70％，Na值分别为1.2838和1.2770，Ne值分别为1.2022和1.1507，h值分别为0.0896和0.1115，I值分别为0.1358和0.1615，平均D值分别为0.0818和0.0996。综合分析上述结果表明，河南省鳜鱼总居群的遗传多样性较为丰富，居群内的遗传多样性丰度也保持在较高水平，但低于总居群水平，2居群的遗传多样性水平差别不大。利用Shannon's信息指数分析居群的变异来源:47.09％存在于居群间，居群内的遗传变异占52.91％，说明鳜鱼遗传分化在居群间和居群内基本一致，都存在较大的遗传分化。居群间遗传分化系数高，Gst为0.5096，基因流低，Nm为0.4812，说明居群间已发生强烈的遗传分化。 (4)用15个ISSR引物对南湾水库、淇河和盘石头水库3个斑鳜自然居群的基因组DNA进行ISSR-PCR扩增，检测到位点147个，多态性比例为56.85％;利用POPGENE软件分析3个斑鳜居群内的PPB值分别为44.22％、19.05％和28.57％，Na值分别为1.4422、1.1905和1.2857，Ne值分别为1.2970、1.1282和1.1862，h值分别为0.1681、0.0732和0.1049，I值分别为0.2473、0.1074和0.1544，平均D值分别为0.1848、0.0722和0.0898。综合上述指标数据说明，河南省斑鳜总居群的遗传多样性丰度较大，3居群的遗传多样性丰度也保持在较高水平，3居群的遗传多样性水平依次为南湾水库居群＞盘石头水库居群＞淇河居群。分析斑鳜居群的变异来源:39.56％存在于居群间，60.44％存在于居群内，说明斑鳜3个居群的遗传分化主要来自于居群内;基于Nei's基因多样性计算斑鳜居群间的遗传分化系数较高，Gst为0.4161，基因流较低，Nm为0.7016，说明居群间已经发生了明显的遗传分化。
乌鳢;鳜鱼;斑鳜;遗传多样性;自然居群
河南师范大学
硕士
遗传学
杨太有
2015
中文
Q959.483
72
2015-12-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）