LPA、GLU、LTF和PLTP基因单核苷酸多态性与冠心病相关性研究
冠心病是危害人类健康影响寿命的重要公共卫生问题之一。已有大量分子流行病学和遗传学研究显示，冠心病是一种复杂的多基因疾病，多种遗传因素和环境因素与冠心病有关，尤其是与脂质代谢相关的多个基因在冠心病发生发展中起重要作用。其中，从2008年至2013年，全基因组关联性研究(genome-wide associationstudies，GWAS)报道了近200个与脂代谢相关位点，得到了丰富的研究成果。 本研究根据GWAS在脂代谢和冠心病中的研究结果，同时结合本实验室的前期研究工作，共筛选了脂蛋白a(Lipoprotein(a)， LPA)基因、凝集素(clusterin，GLU)基因、磷脂转运蛋白(phospholipid transfer protein， PLTP)基因和乳铁蛋白(lactoferrin，LTF)基因这四个候选基因进行其基因单核苷酸多态性研究。 目的:探讨LPA、CLU、PLTP、LTF基因单核苷酸多态性与冠心病的相关性及相关代谢指标的关系。 方法: 1、研究对象 (1)非冠心病组:选择367名冠状动脉造影所示所有冠状动脉主要分支直径狭窄均不大于25％的人群入选至非冠心病组。 (2)冠心病组:选择496名冠状动脉造影所示至少一支心外膜下冠状动脉主要分支直径狭窄大于75％的人群入选至冠心病组。 2、候选基因和SNPs位点的选择:本文根据本实验室前期工作的研究成果，同时结合GWAS在冠心病中的研究结果，确定LPA、CLU、PLTP和LTF这四个候选基因进行单核苷酸多态性研究。SNPs位点选择上，首先选取基因功能区可能对蛋白质水平产生影响的所有SNPs位点，再综合该位点在中国北方汉族人群中最小等位基因频率(Minor Allele Frequency，MAF)和文献检索对该位点其他人群验证结果报道等进行筛选，最终筛选出了10个有意义的SNPs位点。 3、SNPs位点的检测方法:使用基质辅助激光解吸附电离飞行时间质谱分析质谱技术（matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight,MALDI-TOF）进行分型检测。 4、统计分析方法:应用SPSS20.0软件对计数资料进行卡方检验，对正态分布的计量资料进行单因素方差分析，对非正态分布的计量资料进行秩和检验，当P值小于0.05认为具有显著的统计学差异。 结果: 1、Hardy-Winberg平衡检验:9个SNPs位点符合H-W平衡。 2、冠心病组与非冠心病组间关联分析结果: (1)组间等位基因频率的关联分析结果:位于LPA基因上的rs3798220位点(C/T)在等位基因频率方面具有显著统计学差异(P=0.049)，余位点未见显著性差异。 (2)组间基因型频率的关联分析结果:9个SNPs位点均未见显著差异(P＞0.05)。 (3)组间基因模型中基因型频率的关联分析结果:显性模型中LPA基因的rs3798220位点(CC+CT型vs TT型)具有显著的统计学差异(p=0.043)，余位点未见显著差异。隐性模型中CLU基因上的rs3216167位点（DEL型vs A.DEL+AA型）在两组受试者间具有显著的统计学差异P=0.047，余位点未见显著性差异(P＞0.05)。 (4)单倍体分析:rs3798220和rs1801693位点、rs3216167、rs7982、rs1532278位点之间以及rs378114和rs394643位点之间为连锁不平衡区域，各连锁不平衡区域均与冠心病不相关。 3、不同基因型间计量指标的比较: (1) LPA基因:rs3798220位点中血清LPA具有显著的统计学差异(P=0.001);rs1801693位点中未见有显著性差异的血清代谢指标;rs7765803位点中血清LPA具有显著的统计学差异(P=0); (2) CLU基因:rs3216167位点中血清LPA和HbA1c具有显著的统计学差异（P值分别为0.032，0.029）;rs7982位点中血清TC、LDL具有显著的统计学差异（P值分别为0.069，0.051）;rs1532278位点中血清TC水平、LDL、APOB具有显著的统计学差异（P值分别为0.048，0.039和0.052）; (3) LTF基因:rs1126477位点血清TG具有显著的统计学差异(P=0.011); (4) PLTP基因:rs378114位点中未见有显著差异的血清代谢指标;rs394643位点中血清APOB具有显著的统计学差异(P=0.011)。 4、SNP位点等位基因变化引起冠心病风险变化程度 rs3798220位点中，CT+CC型发生冠心病的风险比TT增加了1.5倍。该位点能够解释0.7％的冠心病病因(Nagelkerke R2=0.07)。 5、血LPA和冠心病关系的关联指标 根据rs3798220基因型分组，比较基因型-疾病，基因型-血清LPA水平，推导出血清LPA水平和冠心病关系的关联指标ORLPA-CAD=1.503K.14.64，即血清LPA变化K个单位时发生冠心病的效应值。 结论: 1、LPA基因:rs3798220位点可能通过影响血清LPA水平影响冠心病发生;rs7765803位点可能影响血LPA水平； 2、CLU基因:rs3216167位点可能影响血清LPA水平，并与冠心病发生相关;rs7982位点可能影响血TC、LDL水平;rs1532278位点可能影响血TC、LDL、APOB水平； 3、LTF基因:rs1126477位点可能影响血TG水平； 4、PLTP基因:rs394643位点可能影响血APOB水平； 5、血清LPA变化K个单位史冠心病风险ORLPA-CAD=1.503K.11.61。
冠心病;单核苷酸多态性;脂蛋白a;凝集素;磷脂转运蛋白;乳铁蛋白
中国医学科学院;清华大学医学部;北京协和医学院
博士
临床医学
方圻;曾勇
2015
中文
R541.4
67
2015-11-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）