草果遗传多样性分析及其混淆品的ITS序列差异比较研究
目的：草果Amomum tsaoko Crevost et Lemaire为姜科豆蔻属多年生草本植物，果实为常用中药材。对草果SSR分子标记进行研究，获得草果SSR多态性引物和遗传多样性信息，为草果优良种源的筛选奠定基础；探寻草果与拟草果分子鉴别方法，为草果及其混淆品的分子鉴别奠定基础。
方法：(1)利用磁珠富集法对草果基因组中的微卫星序列进行筛选分离，构建草果微卫星富集文库，得到草果微卫星序列，运用Primer Primer5.0软件进行分析设计引物，利用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测引物多态性，最后选取多态性引物对草果进行遗传多样性分析(2)利用ITS分子标记对草果和混淆品拟草果A.paratsaokoS.Q.TongetY.M.Xia进行ITS分析，根据测序结果用生物信息学软件(CExpress)进行序列比对，用MEGA软件将CExpress产生的比对结果以邻近法(Neighbor Joining)模型生成系统树，揭示两者遗传结构的差异。
结果：(1)用开发出来的7对SSR引物对草果5个居群35个体进行遗传多样性分析，在物种水平上，7对SSR多态性引物共检测到15个等位基因，基于15个等位基因获得的遗传多样性的结果显示：观测杂合度(Ho)的变化范围为0.0000～0.4000,平均值为0.3020；期望杂合度的值(He)变化范围为0.2273～0.6704，平均值为0.3936；Shannon多样性指数变化范围为0.3837～1.0895，平均值为0.6012，Nei遗传多样性指数平均值为0.3879。(2)对草果及拟草果共12个植株进行的ITS分析，草果及拟草果明显分为了两支，遗传结构表现出了极大的差异。
结论：草果群体中存在的遗传多样性不高；ITS序列分析能够准确地将草果与拟草果区分开来，为草果及其混淆品的药材鉴别奠定了基础。
草果;遗传多样性;混淆品拟草果;ITS序列差异;筛选分离;药材鉴别
云南中医学院
硕士
中药学
杨耀文;钱子刚
2012
中文
S567.239
60
2012-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）