天然产物分离的分子动力学模拟研究
本研究采用分子动力学模拟，对大孔树脂D101分离人参皂苷Rg1的机理，以及碳纳米管的特性进行了模拟研究。所使用的模拟软件为GROMACS软件包，除此之外，还使用了很多辅助的分析软件，如Accelrys viewerpro，Tinker，Nanotube Modeler等。大孔树脂D101常用于人参皂苷Rg1的分离以提高分离效果。为了更有效地研究人参皂苷Rg1的分离机理，我们对水体系中的D101，人参皂苷Rg1和蔗糖进行了分子动力学模拟。首先我们研究了D101的四种同分异构体并选出了最优结构。我们用结构因子RDF来分析Rg1的吸附机理及整个体系的稳定构象。我们研究了不同的杂质浓度，不同体系温度（300，330和360K），不同压力（1.0，2.0，3.0和4.0 bar）对体系的吸附的影响。我们发现低浓度杂质有利于吸附，高浓度反而会破坏D101和人参皂苷Rg1之间的吸附平衡，这与实验的结果是一致的；低温环境中，D101与Rg1间的结合能远远强于D101与蔗糖间的结合能，并且能量很稳定；在低压环境中，体系在4ns左右就可以到达平衡，随着压力升高，能量差增大但是同时到达平时的时间也增长，所以我们认为：适当的高压是有利于Rg1分离的。这些模拟数据与实验数据有很好的一致性。
本文在对碳纳米管特性的研究中，将碳纳米管置于水中，发现水分子会进入碳纳米管的空腔内，并且在碳纳米管的空腔内规则地排列成一行，在碳纳米管的外壁则会形成了一个疏水的环境，环绕碳纳米管外壁一圈；在正己烷体系中也有类似的性质。在混合气体的体系中，分子量大的分子更容易被碳纳米管吸引。
中药制剂;药物提纯;人参皂苷;树脂吸附
北京化工大学
硕士
制药工程
冯嵬
2009
中文
TQ461;R284.2
87
2010-01-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）