克雷伯杆菌质粒耐药性研究
目的：
本文研究作为本研究所研究课题的一部分，主要研究了临床上常见也是很重要的致病菌肺炎克雷伯菌的耐药质粒。细菌耐药性的改变，往往与细菌所携带的耐药基因有关，而这些基因往往位于耐药菌所携带的质粒上，可通过质粒或质粒所携带的可移动元件在细菌群体中播散。因此，我们通过对质粒DNA序列的测定，分析质粒所携带的功能基因，从基因组水平研究肺炎克雷伯菌质粒DNA的结构，质粒与宿主菌的耐药性和致病性等的关系，为进一步分析肺炎克雷伯菌质粒DNA结构的演变规律和分子进化，以及肺炎克雷伯菌的耐药性和致病性机理的研究打下基础。
方法：
本课题从温州医学院附属第一医院临床得到206株肺炎克雷伯菌作为本实验菌株来源。采用碱裂解法提取质粒DNA，将全部质粒DNA送交深圳华大基因组科学研究院进行solexa测序，再用SOAP软件对我们关心的耐药基因进行分析，得到分析结果的序列。通过BLAST比对我们关心的基因，通过生物信息的方法，研究所测肺炎克雷伯菌所有质粒包含ESBLs的SNP情况，从而得到不同位点的突变率和新的亚型。对于拼接好的序列，通过BLAST比对蛋白数据库（NCBI库）和COGs，确定蛋白家族。进一步对这些基因进行功能分析，并在基因组水平上研究肺炎克雷伯菌质粒耐药性的传播、演变规律及分子进化机制。
结论：
以上研究表明：
1．在肺炎克雷伯杆菌的质粒中含有大量的耐药基因。
2．所测数据中有大量与已知质粒相同的基因，尤其是耐药基因与结合转移基因，可以认为肺炎克雷伯菌的质粒中耐药基因的传播与质粒的结合转移有关。
3．肺炎克雷伯菌的总的质粒中含有大量与生命代谢相关的基因，类似一个功能齐全的基因组
肺炎克雷伯菌;接合转移基因;抗药基因;水平基因转移;β-内酰胺酶
温州医科大学;温州医学院
硕士
遗传学
包其郁;周铁丽
2009
中文
R378.14
58
2009-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）