广西猪繁殖与呼吸综合征病毒部分Nsp2、ORF5～7基因的克隆、序列分析及分子流行病学调查研究
2006～2008年广西“高热”病期间，本研究通过RT-PCR的方法从广西不同县市的猪血清、流产胎儿、粪便、肺脏、淋巴结、肾脏中扩增得到25株PRRSV的部分Nsp2、ORF5、ORF6、ORF7基因。这四个基因与2005年以前的国内PRRSV分离毒株CH-1a、BJ-4、HB-1、HB-2、HN1的核苷酸同源性分别为77.1％～95.3％、81.9％～97.2％、92.0％～99.0％、85.2％～98.1％，氨基酸同源性分别为55.1％～94.0％；76.0％～95.0％、94.8％～98.9％、77.2％～96.0％，与2006-2007的国内PRRSV变异株JXA1、JX0612、HuN、HuN4、HuB1、HEB1的核苷酸同源性分别为96.3％～99.3％、91.5％～99.7％、98.7％～100％、93.0％～100％，氨基酸同源性分别为74.7％～98.8％、84.1％～100％、97.7％～100％、83.7％～100％，可见本研究毒株与2006-2007年分离的变异株同源性较高；遗传进化树分析表明本研究流行毒株属于美洲型的Ⅱ亚群，与JXA1、JX0612、HuN、HuN4、HuB1、HEB1分布在Ⅱ亚群的同一个分支，亲缘关系较近，这表明本研究毒株与PRRSV变异株可能来源于同一个祖先。
通过GP5的遗传变异分析发现，广西的PRRSV变异并没有明显的地域性，Ⅱ亚群毒株在广西各县市都有分布：但从时间上分析，2003～2005年的广西毒株和2006～2008年的广西毒株分别分布在Ⅱ亚群的两个分支上，且在9aa、16aa、94aa、185aa位点，
本研究毒株与JXA1、JX0612、HUB1、HEB1、HUN、HUN4的变异相同，而2003～2005年的广西毒株却极少发生变异；在54aa、59aa、104aa位点，2003～2005年的广西毒株发生了变异，而本研究的毒株却鲜少发生变异。在GP5中的R13、R151以及M蛋白中的Q16这3个病毒毒力致弱的相关位点，
本研究毒株均未发生改变，但位于GP5蛋白中的病毒首要中和表位发生了变异：L39→I39。在Nsp2氨基酸序列中发现，25个毒株序列的第482和第534～562位出现了1个和29个氨基酸的缺失，但这30个氨基酸的缺失可能不会对病毒的生长动力学产生明显影响。
猪繁殖;呼吸综合征;序列分析;流行病学调查;Nsp2基因;ORF5基因;ORF7基因;氨基酸序列
广西大学
硕士
预防兽医学
黄伟坚
2008
中文
S858.28;S856.3
87
2008-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）