合成PHA基因组克隆片段的序列分析及相关基因的分离
聚-β-羟基烷酸是微生物代谢过程中产生的贮存物质,是制造塑料的新型原料,可被微生物完全降解,利用植物生物反应器合成PHA是现在研究热点。本论文主要研究实验室拥有的从Pseudomanas菌中克隆的合成PHA的基因组片段,利用生物信息学方法分析其序列特征,从中找出与PHA合成相关的基因,并用PCR方法分离这些基因。结果显示:1使用核酸分析软件对合成PHA克隆片段的序列进行分析,找到了五个开放阅读框,其中ORF1、ORF2和ORF3在同源性搜索中与合成PHA相关基因的同源性很高,而ORF4、ORF5与PHA合成的基因几乎没有同源性。2对与ORF1、ORF2和ORF3高度同源性的蛋白序列进行序列比对分析,表明它们与合成PHA的相关基因编码的蛋白序列之间存在高度的保守性,它们的功能可能分别对应于PHA合酶(PhaC)、3-酮硫裂解酶(PhaA)和乙酰乙酰CoA还原酶(PhaB)。其中PHA合酶与其它Pseudomonas菌中的PHA合酶在蛋白质序列上存在较大的差异,可能是一种新的PHA合酶。
聚-β-羟基烷酸;合成PHA;基因组克隆片段;蛋白序列分析;基因编码;植物生物反应器
安徽农业大学
硕士
生物物理学
程备久
2002
中文
Q522.6;Q936
82
2006-12-08(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)