利用SNP标记构建苦荞高密度遗传图谱及重要农艺性状的QTL分析
苦荞是一种重要的药食兼用的小宗作物，因其富含黄酮类物质，具有降血糖、降血脂、降血压等作用而日益受到人们的重视。苦荞产量及重要品质性状大多数为复杂的数量性状，受微效多基因和环境的共同作用，遗传改良难度较大。目前苦荞育种主要是传统育种方法如系统育种、诱变育种等，育种效率低、育种周期长。遗传图谱的构建，可找到与目标性状紧密连锁或共分离的分子标记，即可借助标记辅助选择来缩短荞麦育种周期，进而提高其育种效率。 本研究以苦荞栽培品种“小米荞”为母本和“晋荞2号”作为父本，采用有性杂交所得杂种后代再经“一粒传法”创制而得到分离群体F3代，从中随机选取200份单株材料作为作图群体，对亲本和分离群体分别进行限制性酶切位点相关的DNA（Restriction-site associated DNA，RAD）酶切测序，以此开发大量SNP标记从而构建苦荞高密度遗传图谱，并对株高、单株粒重、百粒重等农艺性状进行QTL分析，研究结果如下： 1.采用RAD酶切测序技术对苦荞亲本和200个F3单株进行简化基因组测序，通过生物信息学分析的方法，在亲本与200个子代中共检测到3614个SNP位点。利用卡方过滤掉偏分离位点，得到了可信度较高的SNP位点共1179个SNP位点。 2.利用上述标记对苦荞进行遗传连锁图谱的构建，去掉位点很少的散列连锁群后，构建的连锁图得到的包含了10个连锁群的连锁图谱，有974个标记，总覆盖遗传距离为1095.88cM，标记间平均距离为0.89cM。 3.通过主要农艺性状的收集及统计，应用QTL IciMapping软件对株高、单株粒重、百粒重进行QTL分析，共检测到27个QTL，检测到与株高相关的QTLs有两个，分别位于第1、7连锁群上，表型贡献率为12.56％-17.14%。与百粒重相关的QTLs有4个，分别位于第1、2连锁群上，解释表型变异率为9.09%-24.52%。与单株粒重相关的QTLs有21个，分别位于第2、3连锁群上，解释表型变异率为35.40%-48.50%。
苦荞;限制性酶切位点;单核苷酸多态性;遗传图谱;农艺性状;遗传改良
贵州师范大学
硕士
遗传学
陈庆富;宋驰
2015
中文
S517.03;S332
93
2015-12-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）