江苏克氏原螯虾典型群体遗传多样性微卫星分析
克氏原螯虾(Procambarus clarkii)是我国重要的淡水经济甲壳类之一，江苏省是我国克氏原螯虾的主要养殖省份之一。克氏原螯虾种质资源的研究对其保护和利用、提高养殖产量、良种选育等具有重要意义。本研究共收集了江苏9个克氏原螯虾天然群体（太湖群体3个、洪泽湖群体3个、骆马湖群体1个、固城湖群体1个，长江江心镇群体1个）与1个克氏原螯虾圈养群体（盱眙满江红群体）。开发了12个克氏原螯虾的EST-SSR标记，分析了这些克氏原螯虾群体的遗传多样性和遗传结构，主要内容如下： 1.克氏原螯虾EST-SSR标记筛选与分析 筛选出12个克氏原螯虾微卫星标记，对60个克氏原螯虾基因组DNA进行扩增并分析其多态性水平，结果显示：12对多态性微卫星标记的等位基因数在3～9之间，平均观测杂合度为0.556，平均期望杂合度值为0.745。经Bonferroni校正后，12个位点均偏离Hardy-Weinberg平衡，多态信息含量（PIC)介于0.509~0.875之间，所有位点均为高度多态位点，可较好地分析遗传结构和多样性，这些标记用于克氏原螯虾遗传多样性分析效果较好。 2.池塘圈养对克氏原螯虾遗传多样性的影响 选用8个微卫星标记研究了盱眙满江红圈养群体、洪泽湖西顺河天然群体及长江江心镇天然群体的遗传多样性，研究表明：8对微卫星引物在3个克氏原螯虾群体中共得到48个等位基因，8个群体有23个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。3个群体中长江江心镇群体的遗传多样性水平最高，盱眙满江红群体的遗传多样性水平最低。群体间遗传分化指数FST及AMOVA分析表明，3个群体遗传分化指数为0.036，存在低等程度的分化（FST＜0.05）。基于遗传距离构建的UPGMA聚类树显示，洪泽湖西顺河群体与长江江心镇群体聚为一支，盱眙满江红群体自成一支。总体而言，三个群体遗传多样性较高且无显著差异，天然群体与圈养群体间存在一定的遗传分化。 3.江苏8个克氏原螯虾群体遗传多样性微卫星分析 利用克氏原螯虾8个微卫星标记分析了江苏省8个天然克氏原螯虾群体，包括：太湖群体3个（大浦、平望、漆塘）；洪泽湖群体3个（官滩、西顺河、太平）；固城湖群体1个（固城）；骆马湖群体1个（洋河滩）的遗传多样性。研究表明：8个群体全部64个位点经Bonferroni法校正后均显著偏离Hardy-Weinberg平衡且绝大多数位点显示杂合不足。8个群体中遗传多样性水平大浦群体最高，平望群体最低。遗传分化指数FST及AMOVA分析表明，8个群体遗传分化指数为0.126，存在中等程度的分化（0.05＜FST＜0.15）。基于遗传距离构建的UPGMA聚类树显示，8个群体可分为4组：平望群体、漆塘群体和大浦群体聚为一组，太平群体、西顺河群体与官滩群体聚为一组，而固城群体、洋河滩群体分别自成一组。江苏克氏原螯虾遗传多样性较高，各群体间存在中低度的遗传分化，克氏原螯虾种群显示了极强的杂合子缺失，人为捕捞可能是造成其杂合子缺失的主要原因。遗传分化指数与地理距离呈显著正相关(r=0.334, P<0.05)。
克氏原螯虾;遗传多样性;微卫星标记;遗传结构
上海海洋大学
硕士
渔业
李家乐
2014
中文
S966.12
50
2015-08-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）