RNA干涉效应分子siRNA分子特性的研究
RNA干涉是近年来发现的小片段双链RNA分子能够特异地沉默基因表达的现象,它被广泛应用于功能基因组的研究、疾病治疗的研究、干细胞的研究及植物抗病毒等领域,各类型的实验室及研究机构广泛开展RNA干涉实验。RNA干涉实验首要的步骤是对候选的siRNA序列进行筛选,但这一过程耗时、繁琐。 为了使候选siRNA分子的筛选过程更加快捷及有效,利用统计学x~2检验方法,分析已发表的高效沉默目的基因的siRNA分子,得到关于siRNA分子的一些分子特性的信息：①siRNA21位点中第1、2、20和21位点A/T碱基频率显着高于G/C碱基频率；②第3、4和6位点G/C碱基频率显着高于A/T碱基频率：③5’端第2—7位G/C碱基含量大于3’端第15—19位点G/C碱基含量；④siRmA片段平均Tm值为31.2°C其可信区间为[25.1°C,37.3°C]。结合前人的研究成果,我们推测这些分子特性与RNA干涉发生过程中涉及的各种酶如Dicer酶、RISC复合体、RNA依赖的RNA聚合酶(RNA depending RNA polymerase,RdRp)等的作用效率有关。 同时,以上述siRNA分子特性为指导,筛选候选siRNA分子,通过载体介导的RNA干涉技术成功地沉默人巨细胞病毒UL49基因表达,由此验证了以这些分子特性为参考,可以快捷有效地筛选出沉默基因表达的siRNA分子,对于候选siRNA分子的筛选具有参考价值。
RNA干涉;siRNA分子;x~2检验;UL49基因沉默
暨南大学
硕士
遗传学
王莹
2005
中文
Q78
2014-05-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）