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西藏地区结直肠良恶性肿瘤的肠道菌群差异研究

韩丹
西藏大学
引用
目的:分析西藏地区结直肠良恶性肿瘤患者肠道菌群间的差异;对各组间肠道菌群进行功能预测分析,判断肠道菌群变化对筛查结直肠腺瘤的有效性。  方法:收集2020年至2022年于西藏自治区人民医院接受肠镜检查的94例患者的临床资料,根据肠镜检查结果及病理活组织检查结果进行分组,分为4组,对照组(18例),非腺瘤性息肉组(29例),腺瘤组(32例),结直肠癌组(15例),结直肠镜检肠道准备之前收取受试者的粪便标本,保存于-20℃冰箱中,然后对粪便样本细菌的DNA抽提,提取后再对16S rRNA基因V3-V4可变区进行PCR扩增及高通量测序,最终得到粪便样本的菌群组成,最后再进行物种多元分析、差异显著性检验等一系列深入的统计学和可视化分析。  结果:1.α 多样性分析显示结直肠癌组较对照组及非腺瘤性息肉组相比物种丰富度显著升高,CRC组物种多样性较腺瘤组明显升高。β多样性分析显示四组间未见明显差异。2.从菌门、菌属水平的组间差异分析显示,结直肠良恶性肿瘤与对照组之间肠道菌群丰度发生了明显的变化,在非腺瘤性息肉组与结直肠癌组的LefSe多级物种差异判别分析显示,非腺瘤性息肉组中以放线菌纲和双歧杆菌属升高为主,结直肠癌组中以拟杆菌升高为主,对两组划分的贡献较大;而在腺瘤组与结直肠癌组的LefSe多级物种差异判别分析显示,腺瘤组中以放线菌和双歧杆菌升高为主,结直肠癌组中以克里斯滕森菌类升高为主,对两组划分的贡献较大。3.结直肠癌组中梭杆菌门、拟杆菌门、梭杆菌属、拟杆菌属丰度显著升高,双歧杆菌属丰度显著下降。4. 表型预测分析结果显示,与对照组相比,表型Potentially-Pathogenic(潜在致病性)在结直肠癌组中丰度显著升高。  结论:与对照组相比,西藏地区结直肠良恶性肿瘤肠道菌群的物种丰富度及多样性存在差异,且在菌门及菌属水平肠道菌群物种丰富度也存在差异, Potentially-Pathogenic(潜在致病性)表型可能对未来结直肠腺癌筛查和发病机制研究奠定一定基础,具有贡献意义,值得进一步扩大样本量进行深入研究,探索能有效筛查结直肠癌的表型。

结直肠良恶性肿瘤;肠道菌群;发病机制;西藏地区

西藏大学

硕士

内科学

次仁央金

2023

中文

R735.34;R730.23

2023-09-19(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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