结直肠癌中LMCD1的差异表达及生物学作用的研究
目的： 本研究采用生信技术、二维液相色谱-质谱联用技术、Westernblot技术和免疫组化技术研究了LMCD1蛋白在结直肠癌组织和癌旁组织中的差异表达，通过细胞功能实验进一步验证了LMCD1蛋白的差异表达在结直肠癌细胞中的生物学功能作用，在肠癌的早期筛查方面提供了新的目标，也在结直肠癌生物机制作用的探究中提供了一个新的战略思路。 方法： 1.通过Timer数据库确定LMCD1在结直肠癌中的差异表达。通过TCGA数据库挖掘正常结直肠组织和结直肠癌组织的基因表达谱数据，经过统计测算，再次确证LMCD1在结直肠癌中的表达情况。通过TISIDB数据库发现LMCD1与癌免疫亚型的关联。通过Cbioportal数据库挖掘LMCD1的基因突变和共表达基因情况。通过LinkedOmics数据库得到LMCD1正负相关基因热图和功能富集图。通过STRING数据库探究LMCD1蛋白之间的相互作用。 2.二维液相色谱-质谱联用技术检测24例结直肠癌及癌旁组织中蛋白LMCD1的表达情况。免疫组化技术检测45例肠癌组织及癌旁组织中LMCD1的蛋白表达情况。 3.成功构建LMCD1过表达和沉默表达SW620细胞株，通过观察绿色荧光、RT-qPCR技术及Westernblot试验验证转染效率，通过细胞增殖实验、细胞划痕实验检测LMCD1蛋白差异表达对细胞生物学功能的影响。 结果： 1.LMCD1在结直肠癌等多种肿瘤中上调表达。 2.二维液相色谱-质谱联用技术表明LMCD1在结直肠癌组织中高表达，免疫印迹和免疫组化也进一步进行了验证。 3.成功构建瞬时转染SW620过表达及敲低表达细胞株，细胞功能实验表明过表达LMCD1可促进细胞的增殖和迁移功能，而沉默表达LMCD1可抑制细胞的增殖和迁移功能。 结论： 1.LMCD1在结直肠癌组织中上调表达。 2.LMCD1上调表达可促进结直肠癌细胞的增殖和迁移功能，可能作为结直肠癌诊断的潜在生物标志物。
结直肠癌;生物信息学;二维液相色谱-质谱联用技术;免疫组化;细胞功能实验;LMCD1蛋白
吉林大学
硕士
临床检验诊断学
方玲
2023
中文
R735.3
2023-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）