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目录
主要符号对照表
第一章绪论
1.1动物源细菌耐药现状
1.2动物源细菌的耐药机制
1.2.1细菌固有耐药作用机制
1.3细菌的获得性耐药机制
1.3.1水平转移方式
1.3.2水平转移元件
1.4本研究的目的及意义
第二章大肠杆菌E126和鲍曼不动杆菌ab201A的分离鉴定
2.1引言
2.2材料
2.2.1样品
2.2.2菌株
2.2.3主要试剂
2.2.4主要设备仪器
2.2.5主要溶液制备
2.2.6引物
2.3方法
2.3.1菌株的分离、鉴定与冻存
2.3.2 K-B纸片琼脂扩散法（Kirby-Bauer disk agar diffusion method）检测药物敏感性
2.3.3微量肉汤稀释法检测最小抑菌浓度（Minimum inhibitory concentration，MIC）
2.4结果
2.4.1菌株的分离、鉴定
2.4.2候选菌株K-B纸片琼脂扩散法检测结果
2.4.3 MIC检测结果
2.5 讨论
第三章大肠杆菌E126和鲍曼不动杆菌ab201A染色体精细图
3.1引言
3.2材料
3.2.1菌株
3.2.2主要试剂
3.2.3主要仪器设备
3.2.4主要溶液制备
3.3方法
3.3.1大肠杆菌E126和鲍曼不动杆菌ab201A细菌基因组DNA的提取
3.3.2全基因组测序、组装和注释
3.3.3染色体耐药基因、毒力基因和基因岛的预测与分析
3.3.4菌株多位点序列分型（Multilocus sequence typing，MLST）预测与分析
3.4结果
3.4.1大肠杆菌E126染色体组分分析
3.4.2大肠杆菌E126染色体耐药基因和毒力基因分析
3.4.3大肠杆菌E126染色体基因岛和IS分析
3.4.4大肠杆菌E126菌株多位点序列分型分析
3.4.5鲍曼不动杆菌ab201A染色体组分分析
3.4.6鲍曼不动杆菌ab201A染色体耐药基因和毒力基因分析
3.4.7鲍曼不动杆菌ab201A MLST和基因岛分析
3.5 讨论
第四章大肠杆菌E126和鲍曼不动杆菌ab201A潜在水平转移元件的分析
4.1引言
4.2材料
4.2.1菌株
4.2.2主要试剂
4.2.3主要仪器设备
4.2.4主要溶液制备
4.2.5引物
4.3方法
4.3.1质粒的预测与分析
4.3.2其他转移元件的预测与分析
4.3.3细菌接合转移
4.4结果
4.4.1大肠杆菌E126质粒耐药基因预测
4.4.2大肠杆菌E126质粒的多重序列比对
4.4.3大肠杆菌pE126-1 blaOXA-10基因环境分析
4.4.4大肠杆菌E126细菌接合试验及其他水平转移元件的分析
4.4.5鲍曼不动杆菌ab201A质粒和转移元件的分析
4.5讨论
第五章新型抗菌化合物的筛选及作用机制
5.1引言
5.2材料
5.2.1菌株
5.2.2主要试剂
5.2.3主要仪器设备
5.2.4主要溶液制备
5.3方法
5.3.1微生物对化合物的敏感性检测
5.3.2化合物最小抑菌浓度检测
5.3.3样品制备
5.3.4鲍曼不动杆菌ab201A原核链特异性差异转录组测序
5.4 结果
5.4.1化合物的筛选
5.4.2样本间表达量分析
5.4.3基因表达量差异分析
5.4.3基因集分析
5.5讨论
第六章结论
参考文献
附录A
致谢
作者简历