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目录
主要符号对照表
第一章绪论
1.1 代谢性疾病模型现状
1.1.1 低等模式动物模型
1.1.2 啮齿类动物模型
1.1.3 其它哺乳动物模型
1.2 可变剪接
1.2.1 可变剪接的机制
1.2.2 可变剪接的调控
1.2.3 可变剪接的类型
1.2.4 可变剪接的功能
1.2.5 可变剪接在代谢性疾病中的研究进展
1.3 CPB2基因功能及可变剪接研究现状
1.4 本实验室转三基因代谢性疾病易感猪概述
1.5 研究目的及意义
1.6 技术路线
第二章材料与方法
2.1 材料与试剂
2.1.1 材料
2.1.2 试剂
2.2 仪器设备与耗材
2.2.1 仪器设备
2.2.2 耗材
2.3 实验方法
2.3.1 组织总RNA提取（TRIzol传统法）
2.3.2 RNA完整性及质量浓度检测
2.3.3 RNA-seq建库及测序
2.3.4 RNA-seq数据序列比对与组装
2.3.5 可变剪接的鉴定与分析
2.3.6 差异剪接基因的GO和KEGG富集分析
2.3.7 剪接因子获取与差异表达分析
2.3.8 皮尔逊相关性分析
2.3.9 cDNA反转录
2.3.10 引物设计与合成
2.3.11 半定量PCR实验
2.3.12 琼脂糖凝胶DNA目的条带回收
2.3.13 基因克隆测序
2.3.14 实时荧光定量PCR实验
2.3.15 生物信息学工具
2.3.16 作图工具
2.3.17 统计学分析
第三章实验结果
3.1 代谢性疾病模型猪饲养管理的探讨
3.1.1 代谢性疾病模型猪构建因素的汇总
3.1.2 已报道代谢性疾病模型猪诱导饲料方案汇总与分析
3.1.3 代谢性疾病模型猪饲养管理方案
3.2 富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接的影响
3.2.1 原始测序数据过滤以及高质量序列数据基因组比对
3.2.2 四种代谢相关组织的可变剪接总体分布特征
3.2.3 四种代谢相关组织差异剪接基因分布特征
3.2.4 差异剪接基因富集分析
3.2.5 肝脏中剪接因子的分析
3.2.6 肝脏中重点基因可变剪接事件和表达量验证
3.3 猪CPB2基因可变剪接体的克隆及生物信息学分析
3.3.1 猪CPB2基因的可变剪接体克隆
3.3.2 猪CPB2基因的可变剪接分析
3.3.3 猪CPB2蛋白生物信息学分析
3.3.4 猪CPB2基因可变剪接体的组织表达谱
3.3.5 富营养饮食下代谢性疾病易感猪肝脏中CPB2基因表达分析
第四章讨论
4.1 可变剪接整体特征分析
4.2 富营养饮食对代谢性疾病易感猪关键组织可变剪接的影响
4.3 猪CPB2基因可变剪接体特征及功能分析
第五章结论
5.1 研究结论
5.2 研究创新点
5.3 展望
参考文献
附录
致谢
作者简历