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第一章绪论
1.1 虾虎鱼类的研究概述
1.1.1 虾虎鱼类介绍
1.1.2 斑尾刺虾虎鱼介绍
1.2 DNA条形码
1.2.1 DNA条形码介绍
1.2.2 DNA条形码研究进展
1.2.3 DNA条形码的优势及问题
1.2.4 DNA条形码在海洋渔业中的应用
1.3 种群遗传学的研究方法
1.3.1种群遗传学介绍
1.3.2研究方法
1.3.3线粒体DNA标记
1.3.4 GBS简化基因组测序技术
第二章黄渤海虾虎鱼DNA条形码分类体系构建
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 实验材料
2.2.2 DNA提取
2.2.3 PCR扩增及DNA测序
2.2.4 参考DNA条形码序列下载
2.2.5 数据分析
2.3 结果与分析
2.3.1 虾虎鱼样品形态学初步鉴定
2.3.2 DNA条形码物种鉴定
2.3.3 虾虎鱼系统发育关系
2.4讨论
2.5 小结
第三章基于D-loop和COI基因的斑尾刺虾虎鱼群体遗传结构分析
3.1引言
3.2 材料与方法
3.2.1 样本来源
3.2.2线粒体DNA提取
3.2.3 数据处理与分析
3.3实验结果
3.3.1线粒体DNA序列变异分析
3.3.2种群遗传多样性参数
3.3.3群体遗传结构分析
3.3.4 基因流分析
3.3.5 种群历史动态分析
3.4 讨论
3.5 小结
第四章基于GBS简化基因组的斑尾刺虾虎鱼群体遗传学研究
4.1引言
4.2材料与方法
4.2.1实验材料
4.2.2 实验方法
4.2.3 群体遗传多样性分析
4.3 结果
4.3.1 简化基因组测序结果及数据过滤
4.3.2 GBS tag数产出数据统计
4.3.3 群体遗传多样性分析结果
4.4 讨论
4.4.1 GBS测序技术在种群遗传学中的应用
4.4.2 群体遗传多样性分析
4.5 小结
第五章结论
参考文献
致谢
作者简历