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主要符号对照表
第一章绪论
1.1 畜禽舍氨气来源
1.2 畜禽舍氨气浓度及限值标准现状
1.3 畜禽体内氨的代谢途径
1.4 环境氨气暴露危害畜禽生长及骨骼肌生理表征的研究进展
1.4.1 环境氨气暴露制约畜禽生长
1.4.2 环境氨气暴露改变肌肉生理表征
1.5 环境氨气暴露改变肌肉生理表征的潜在分子机制
1.5.1 氨诱导肌肉生长抑素表达影响肌细胞生长
1.5.2 氨影响肌细胞能量代谢
1.5.3 氨引起氧化应激与炎症反应损伤肌细胞
1.5.4 氨影响肌肉内脂质代谢
1.5.5 微生物-肠-肌肉轴在氨暴露改变肌肉生理表征中的潜在作用
1.6 小结
1.7 本研究的目的和意义
1.7.1 研究目的及意义
1.7.2 技术路线
第二章环境氨暴露影响生长猪骨骼肌肌纤维发育和脂质代谢
2.1 材料与方法
2.1.1 试验设计与样本采集
2.1.2 肌肉生理指标测定
2.1.3 血清中氨和尿素测定
2.1.4 血清中游离氨基酸谱
2.1.5 背肌中特定游离氨基酸
2.1.6 实时荧光定量PCR反应检测基因表达
2.1.7 Western blot检测蛋白表达
2.1.8 转录组测序
2.1.9 数据处理与统计分析
2.2 结果
2.2.1 环境氨暴露对猪生长性能和肌肉生理指标的影响
2.2.2 环境氨暴露对猪血清中氨、尿素和游离氨基酸含量的影响
2.2.3 环境氨暴露对猪肌肉特定游离氨基酸含量的影响
2.2.4 环境氨暴露对猪肌肉中MSTN及mTOR通路中关键分子表达的影响
2.2.5 氨暴露相关的差异表达基因
2.2.6 GO注释和KEGG通路富集分析
2.2.7 实时荧光定量PCR验证RNA-Seq
2.3 分析与讨论
2.4 小结
第三章环境高氨暴露通过mTOR通路调节猪骨骼肌脂质代谢
3.1 材料与方法
3.1.1 试验伦理声明
3.1.2 试验动物和分组
3.1.3 样品采集
3.1.4 肌肉生理指标测定
3.1.5 血清中血氨、尿素以及游离氨基酸测定
3.1.6 血清中脂质相关代谢物测定
3.1.7 肌肉中游离脂肪酸测定
3.1.8 qRT-PCR检测基因表达
3.1.9 转录组测序
3.1.10 Western blot检测蛋白表达
3.1.11 统计分析
3.2 结果
3.2.1 高氨暴露对猪肌肉生理指标的影响
3.2.2 高氨暴露对猪肌肉中游离脂肪酸含量的影响
3.2.3 高氨暴露对猪血清中游离氨基酸、血氨以及脂质相关物质含量的影响
3.2.4 转录组分析
3.2.5 高氨暴露对猪肌肉中AMPK和mTOR信号通路中关键分子表达的影响
3.3 分析与讨论
3.4 小结
第四章不同浓度环境氨暴露干扰猪器官间氨处理和支链氨基酸分解代谢
4.1 材料与方法
4.1.1 试验伦理声明
4.1.2 试验动物和试验设计
4.1.3 样品采集
4.1.4 靶向代谢组学定量检测组织游离氨基酸
4.1.5 qRT-PCR检测基因表达
4.1.6 统计分析
4.2 结果
4.2.1 肺脏组织中游离氨基酸含量及氨代谢相关基因表达水平
4.2.2 肝脏组织中游离氨基酸含量及氨代谢相关基因表达水平
4.2.3 肌肉组织中游离氨基酸含量及氨代谢相关基因表达水平
4.2.4 肾脏中游离氨基酸含量
4.2.5谷氨酸-谷氨酰胺和BCAA分解代谢相关酶基因表达的空间分布
4.3 分析与讨论
4.4 小结
第五章高氨暴露导致生长猪后肠微生物紊乱和微生物来源代谢物的改变
5.1 材料与方法
5.1.1 动物试验伦理
5.1.2 试验动物和暴露条件
5.1.3 样品采集
5.1.4 血清代谢物测定
5.1.5 血清和肠道内容物中胆汁酸测定
5.1.6 肠道内容物中短链脂肪酸测定
5.1.7 肠道内容物中DNA提取、扩增和测序
5.1.8 数据分析与统计检验
5.2 结果
5.2.1 高氨暴露对猪血清中血脂相关代谢物和游离氨基酸含量的影响
5.2.2 高氨暴露对猪血清中胆汁酸谱的影响
5.2.3 总体测序数据评估
5.2.4 高氨暴露对后肠微生物α和β多样性变化的影响
5.2.5 高氨暴露下后肠特定菌群的改变
5.2.6 高氨暴露对后肠短链脂肪酸和胆汁酸含量的影响
5.2.7 微生物和代谢物的相关性
5.3 分析与讨论
5.4 小结
第六章全文结论
6.1 结论
6.2 本论文的创新点
6.3 有待进一步研究的问题
参考文献
附录A
致谢
作者简历