计算机辅助limk1抑制剂的开发
limk1是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶，主要在细胞质中对含肌动蛋白细胞骨架的组装起作用。当它受激活后可以使丝切蛋白磷酸化，逆转丝切蛋白诱导的肌动蛋白解聚从而促进细胞的大量增长。本论文主要运用3D-QSAR、分子对接、分子动力学模拟和结合自由能计算等方法对limk1抑制剂进行研究以期得到指导化合物设计的信息。 在对尿素骨架的limk1抑制剂研究中，我们把抑制剂划分为5个区域并总结出这两个模型的构效关系。在对接中形成很多作用力且残基为Ala353、Glu414、Ile416、His464、Asn465和Leu467，并进行了5ns的动力学验证。根据以上指导信息设计5个尿素骨架衍生物并进行了合成和生测，最终数据表明这5个化合物的活性和选择性都很好。在研究氟原子的引入对limk1抑制剂活性影响时，4个复合物的动力学模拟RMSD值均在3?左右，体系稳定性较好。对复合物RMSF分析，氟原子与残基Gly346之间的作用力及氨基酸残基的波动对活性很重要。通过自由能计算可知静电力和范德瓦尔斯力对limk1抑制剂的活性非常重要。
limk1抑制剂;尿素类衍生物;分子对接;分子动力学模拟;3D-QSAR
上海应用技术大学
硕士
制药工程
殷燕
2016
中文
TQ460.1
2021-11-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）