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急性髓系白血病突变基因的相关分析

李亚楠
河北工程大学
引用
目的:分析基于二代测序(NGS)的初诊急性髓系白血病(AML)患者基因突变情况,探讨初诊AML患者的基因突变特点。  方法:回顾性分析2018年9月至2020年9月在邯郸市第一医院血液内科收治的初诊的急性髓系白血病(非APL)患者的临床资料120例。基于二代测序(NGS)进行AML相关基因突变的检测,分析AML患者的突变频率及突变分布,探讨突变基因与不同年龄段及不同染色体核型的关系。  结果:  1.120例患者中突变检出率在10%以上的突变基因依次为NPM1(22.50%),DNMT3A(22.50%),NRAS(19.17%),TET2(15.83%),CEBPA(14.17%),WT1(12.50%),GATA2(12.50%),FLT3-ITD(12.50%),FLT3-TKD(11.67%),ASXL1(11.67%)。同时携带≥5个基因突变的患者更容易发生在≥60岁患者中,差异有显著统计学意义。  2.研究结果显示DNMT3A、NPM1和FLT3突变之间存在显著的重叠协同的联系。IDH1/2与NPM1突变之间,CEBPA与GATA2突变之间,ASXL1与RUNX1突变之间及NRAS与ASXL1突变之间也存在显著的共存关系(P<0.05),差异有统计学意义。相反的,FLT3突变可能与KIT、KRAS、RUNX1突变相互排斥;RUNX1突变可能存在与NPM1、CEBPA、WT1突变相互排斥;IDH1/2突变可能与TET2、WT1、CEBPA、GATA突变相互排斥;KIT突变可能与IDH1/2、TET2、WT1、N/KRA、WT1突变相互排斥。  3.研究结果显示,年龄<60岁的AML患者常见的突变基因依次为DNMT3A、(15.93%),NRAS(15.04%),NPM1(14.16%),CEBPA(12.39%),WT1(11.50%),GATA2(11.50%)。而年龄≥60岁的AML患者常见的突变基因依次为TET2(11.50%)、NPM1(9.73%),DNMT3A(7.96%),BCORL1(7.96%),ASXL1(7.08%)  将突变基因按照年龄段分组结果示,TET2、ASXL1、SRSF2、TP53及BCORL1突变在≥60岁的AML患者中突变频率显著增高,差异有统计学意义。而WT1和GATA2突变在<60岁患者中有明显增高趋势。  4.将突变基因按照功能类型分类结果显示,信号转导基因(FLT3-ITD、FLT3-TKD、KIT、NRAS、KRAS、PTPN11、CBL、NF1)(27.91%)最为常见,其次是髓系转录因子(RUNX1、WT1、CEBPA、GATA2、CUX1、ETV6)(20.93%)和DNA甲基化基因(DNMT3A、TET2、IDH1/2)(20.60%),随后是染色体修饰基因(ASXL1、EZH2、BCOR、BCORL1、KMT2A)(11.30%),核磷蛋白(NPM1)(8.97%),RNA剪接基因(SF3B1、SRSF2、U2AF1、ZRSR2)((5.32%),肿瘤抑制因子(PHF6、TP53)(2.99%),黏附素复合体基因(STAG2、RAD21、SMC3)(2.66%)。  将不同功能类型突变基因按年龄段分组结果显示,DNA甲基化、染色体修饰基因、RNA剪接基因及肿瘤抑制基因在≥60岁的AML患者中突变频率显著增多,差异有显著统计学意义。髓系转录因子在<60岁的患者中突变频率显著增多,差异有统计学意义。  5.将突变基因按不同细胞遗传学分组,NPM1和DNMT3A在预后中等组中突变频率显著增高;C-KIT突变在预后良好组显著增高,且多见于t(8;21)染色体易位的AML患者;TP53突变在预后不良组更多见,且多见于复杂核型,差异均有统计学意义。  结论:  1.AML突变基因在不同年龄段的突变频率不同。TET2、ASXL1、SRSF2、TP53及BCORL1突变在≥60岁患者中更多见,而WT1和GATA2突变在<60岁患者中有明显增高趋势。  2.AML突变基因之间存在相互协同和相互排斥的突变模式。本研究发现DNMT3A、NPM1与FLT3突变,IDH1/2与NPM1突变,CEBPA与GATA2突变,ASXL1与RUNX1突变及NRAS与ASXL1突变之间存在显著的共存关系。而FLT3突变可能与KIT、KRAS、RUNX1突变互斥;RUNX1突变可能与FLT3、NPM1、CEBPA、WT1突变互斥;IDH1/2突变可能与TET2、WT1、CEBPA、GATA突变相互排斥;KIT突变可能与IDH1/2、TET2、WT1、N/KRA、WT1突变相互排斥。  3.不同功能类型的突变基因在不同年龄段的分布不同。DNA甲基化、染色体修饰基因、RNA剪接基因及肿瘤抑制基因在≥60岁的AML患者中多见。而髓系转录因子在<60岁的患者中多见。  4.AML患者在不同核型组的基因突变发生频率不同。NPM1和DNMT3A突变在预后中等组多见;C-KIT突变在预后良好组更多见,尤其多见于t(8;21)染色体易位的患者;TP53突变在预后不良组更多见,尤其多见于复杂核型。

急性髓系白血病;二代测序;基因突变;预后评估

河北工程大学

硕士

临床医学

李焱

2021

中文

R733.71

2021-08-23(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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