TBX5基因多态性与先天性心脏病遗传易感性的关联研究
目的： 以中国人群单纯性先天性心脏病的患儿与健康正常对照儿童为研究对象。利用高分辨率熔解曲线检测TBX5基因3'非翻译区单核苷酸多态性，研究其与先天性心脏病易感性的关联。同时探讨基因及环境因素对先天性心脏病发生的影响，分析TBX5基因、MTHFR基因与环境因素的交互作用，从而更全面的认识并解释先天性心脏病发生发展的可能机制，为先天性心脏病高危人群的识别及先天性心脏病的预防干预措施提供科学依据。 方法： 1．按照病例对照研究设计要求，收集186例单纯性先天性心脏病患儿和200例健康正常儿童血液，并收集病例组与对照组父母的环境暴露因素。 2．筛选TBX5基因3'非翻译区标签SNP。抽提研究人群血液基因组DNA;PCR扩增TBX5基因非编码区；应用高分辨率熔解曲线检测TBX5基因3'非翻译区SNP并对该段区域测序验证。 3．统计病例组与对照组TBX5基因3'非翻译区SNP基因型及等位基因频率，利用SHEsis软件对对照组Hardy-Weinberg遗传平衡进行检验。利用SPSS22.0统计软件包对实验数据进行统计学处理，利用x2检验分析TBX5基因3'非翻译区SNP在病例组与对照组基因型及等位基因频率的差异；非条件logistic回归模型分别研究环境因素与先天性心脏病的关系并计算其比值比及其95%可信区间。利用多因子降维法(MDR)对基因与基因、基因与环境因素交互作用进行分析。 结果： 1．运用HaploView软件筛选出TBX5基因3'非翻译区有意义的标签SNP rs883079，运用高分辨率熔解曲线法成功检测出该SNP位点(rs883079)三种基因型G/G、G/A和A/A，测序验证发现与高分辨率熔解曲线法结果一致。 2．TBX5基因rs883079位点在对照组基因型频率符合Hardv-Weinberg遗传平衡，可认为对照组人群来自总体人群，不存在选择性偏倚，具有群体代表性(x2=0.378，P=0.539)。 3．基因分型分析显示：TBX5基因rs883079G＞A位点的突变等位基因A的频率在对照组中为42.50%，在病例组中为50.27%，经卡方检验，该位点的等位基因频率在对照组和病例组中的分布差异有统计学意义(x2=4.68，P=0.031)。TBX5基因rs883079位点G/G、G/A和A/A基因型在对照组中的分布频率分别为32．00%、51．00%和17.00%，在病例组分布频率分别为27.96%、43.55%和28.49%，该位点基因型在对照组和病例组中的分布差异具有统计学意义(x2=4.47，P=0.035)。 TBX5基因rs883079G＞A位点中，以携带G/G野生纯合子基因型者为对照，携带突变杂合子基因型G/A与先天性心脏病发病风险无关，OR为0.924(95%CI:0.612-1.561，P=0.924)。携带突变纯合子基因型A／A的个体患先天性心脏病的危险性升高，OR为1.919（95%CI:1.090-3.376，P=0.023），A/A为先天性心脏病的危险基因型。研究表明，与携带G等位基因者比较，携带突变等位基因A的个体可能提高患先天性心脏病的危险性，OR为1.368（95%CI:1.030-1.817，P=0.031），突变等位基因A为先天性心脏病的危险性等位基因。 4．通过单因素Logistic回归分析，结果筛选出先天性心脏病的可能影响因素有：母亲生育年龄OR值为1.123（95%CI:1.025-1.23）、妊娠高血压综合征OR值为3.174（95%CI：1.000-10.077）、母亲流产史OR值为2.414（95%CI：1.122-5.194）、避孕药服用史OR值为1.870（95%CI:1.006-3.475）、孕期感冒史OR值为1.744(95%CI：1.067-2.852)、孕期精神刺激事件OR值为1.940（95%CI:1.092-3.447）发生先天性心脏病的风险升高。孕期良好情绪是先天性心脏病的保护性因素OR值为0.701(95%CI:0.544-0.904)。 对上述单因素非条件logistic分析筛选出的影响因素，应用多因素非条件logistic回归模型进行分析，筛选出2个先天性心脏病的影响因素，分别为妊娠高血压综合征和孕期良好情绪状态，OR值分别为3.824（95%CI:1.080-13.542）和0.664(95%CI：0.506-0.873)。 5.1阶交互作用的最佳预测模型为孕母情绪状态和MTHFR基因C677T(rs1801133)位点多态，交叉验证一致性较高。2阶交互作用的最佳预测模型为孕母情绪状态、MTHFR基因C677T(rs1801133)位点多态与TBX5基因rs883079位点多态，拟合均衡准确性为0.685，检测均衡准确性为0.613，交叉验证一致性为10/10，为最优交互模型。 结论： 1．TBX5基因SNP位点rs883079多态性与先天性心脏病存在统计学关联。TBX5基因rs883079G＞A携带突变纯合子基因型A/A的个体患先天性心脏病的危险性升高，A/A为先天性心脏病的危险基因型（OR=1.919，95%CI:1.090-3.376）。突变型等位基因A为先心病的危险等位基因（OR=1.368，95%CI:1.030-1.817）。 2．妊娠高血压综合征是先天性心脏病的危险因素(OR=3.824，95%CI：1.080-13.542)，孕期良好情绪状态是先天性心脏病的保护因素。(OR=0.664，95%CI：0.506-0.873)。 3．基因-环境交互作用MDR分析的结果显示：MTHFR基因C677T与孕期情绪存在1阶交互作用，MTHFR基因C677T、孕期情绪与TBX5基因rs883079位点存在2阶交互作用。
先天性心脏病;遗传易感性;TBX5基因;单核苷酸多态性
泰山医学院
硕士
流行病与卫生统计学
李栋;于华凤
2016
中文
R541.102
2020-10-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）