家禽和野鸟中禽流感病毒多样性的研究
流感病毒是一种负链RNA病毒，其基因组由8个片段组成，可广泛感染禽类和哺乳动物。一些禽流感病毒（如H5N1、H7N9等）可通过跨宿主传播感染人类，在人群中导致疾病或死亡，正严重地威胁着全球公共卫生的安全。以往对禽流感病毒多样性的研究主要集中于单一国家或区域等小范围内，而涉及到全球范围内禽流感病毒多样性的研究较为少见。 本研究系统地收集了全球范围内75个地区共11年的禽流感病毒内部基因序列数据，构建了一个禽流感病毒内部基因序列数据库。本研究绘制了全球禽流感内部基因取样地点分布图，计算了家禽和野鸟中禽流感病毒内部基因的遗传多样性。通过对多样性与纬度梯度进行了拟合回归分析发现在野鸟中禽流感病毒内部基因的遗传多样性随纬度梯度的升高而增大。一般认为野鸟是禽流感病毒的自然储主，因此野鸟中的禽流感病毒应比家禽具有更高的遗传多样性。但目前尚无实证分析来检验该理论推测。通过比较家禽和野鸟中禽流感病毒内部基因的遗传多样性发现野鸟中禽流感病毒内部基因的遗传多样性并没有明显地高于家禽。为避免取样误差，本研究也对家禽和野鸟中HA和NA亚型的数量进行了比较以及取样面积与遗传多样性之间相关性进行了检验，发现相关因素对内部基因多样性并无影响。本研究计算了禽流感病毒内部基因在家禽和野鸟之间的传播速率，发现禽流感病毒的传播存在两条途径，既可以从野鸟传到家禽，也可以从家禽传到野鸟。本研究指出禽流感病毒内部基因在19世纪末期发生的全球性同步选择清除以及禽流感病毒在野鸟和家禽间的频繁传播可以解释家禽和野鸟之间禽流感内部基因的遗传多样性无明显差异。本研究搜集了全球范围内107个地区共11年的禽流感病毒外部基因数据，比较了家禽和野鸟中禽流感病毒外部基因的遗传多样性。对于外部基因，家禽和野鸟中禽流感遗传多样性并无一致规律。而19世纪末期发生的禽流感病毒基因的全球性同步选择清除并不涉及外部基因。 本研究对全球范围内家禽和野鸟禽流感病毒的遗传多样性进行了系统的分析，扩展了我们对禽流感病毒多样性的认识，对我们全面理解流感病毒的进化具有十分重要的意义。
禽流感病毒;遗传多样性;系统进化树;基因序列
南京师范大学
硕士
生物学
韩管助
2019
中文
S855.3
2020-04-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）