PHF20相互作用蛋白质组学分析及其在肿瘤中的作用研究
研究目的: PHF蛋白家族主要是含有PHD（PlantHomeodomain）结构域的锌指蛋白。具有植物同源结构域的锌指蛋白20（PHF20）是一个潜在的转录因子，它可以特异性识别甲基化的赖氨酸，并且是赖氨酸乙酰转移酶复合体MOF-NSL的一个亚基，催化组蛋白H4乙酰化和非组蛋白的乙酰化。研究表明PHF20的表达与乳腺癌的发生发展有着密切的关系，但是其分子机制并不是十分得清楚。因此，本研究旨在初步分析PHF20的相互作用蛋白，初步探索PHF20在肿瘤发生发展中的作用。 研究方法: 1.通过免疫亲和纯化联合银染质谱的方法，确定可能与PHF20有相互作用的蛋白，再应用免疫共沉淀的实验方法对银染质谱结果进行验证。 2.对质谱得到的相互作用蛋白进行KEGG分析、PPI分析和GO分析，寻找PHF20相互作用蛋白参与的表观遗传转录调控相关的信号通路。 3.利用乳腺癌细胞系进行体外实验，包括EDU检测细胞增殖和Transwell实验检测细胞侵袭。 4.使用TCGA数据库、GEO数据库、GEPIA分析和KM-plot生存分析，进一步探究PHF20与恶性肿瘤的关联性。 结果: 1.PHF20可以与KDM4A、EZH2、EED和RbAp46/48特异性结合，发挥表观遗传调控作用。 2.PHF20相互作用蛋白参与许多表观遗传转录调控相关的信号通路，如：染色质组装、组蛋白修饰、基因表达调控等，PHF20相互作用网络中包含了许多表观遗传相关的复合物，如NuRD复合物、PcG复合物、MLL复合物和DNA损伤修复复合物等。 3.EdU和转移小室实验表明，干扰PHF20的表达后与对照细胞相比，其增殖和侵袭能力显著降低。 4.临床数据分析表明PHF20在多种肿瘤组织中高表达，并与不良预后相关。 结论: 我们的研究首次发现PHF20在体内与多种表观遗传调控相关的复合物相互作用，并促进肿瘤细胞增殖和侵袭的能力。首次发现PHF20在乳腺癌和多种肿瘤组织中高表达，提示PHF20可能是一个潜在的肿瘤标记物，为乳腺癌以及其它肿瘤的诊断和治疗提供了一个新的靶点。
乳腺癌;蛋白质组学;PHF20蛋白;细胞增殖;肿瘤侵袭
天津医科大学
硕士
基础医学
王艳
2019
中文
R737.9
2020-03-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）