瑟伯氏棉X三裂棉种间遗传连锁图的构建
棉花作为用途广泛的农作物，其棉纤维可以用于纺织工业，棉籽可作为重要的油料来源，棉花的茎秆也可做工业材料和牲畜饲料，它对我国经济的发展也起着不可忽视的作用。目前棉花生产上面临的主要问题是陆地棉栽培种遗传资源狭窄，短时间内很难培育突破性新品种，从而导致了棉花产量上增产困难、品质上很难提高、抗逆性状改良效果不明显。由于陆地棉栽培种的产量占世界棉花总产量的90%以上，我们有必要通过多种有效途径，拓宽棉花遗传资源，比如从棉属野生种中发掘优良性状基因源，丰富我国棉花种质资源的遗传多样性。 在本研究中，二倍体野生棉母本材料为瑟伯氏棉(Gossypium. thurberi），它主要起源于美洲，具有抗黄萎病、棉铃虫以及抗零下低温等特性；父本材料为三裂棉(Gossypium. trilobum)，起源并分布于墨西哥西部sinaloa州和中部Michoacan州等,它具有高抗黄萎病以及耐干旱的特性。本实验利用种间杂交产生的 F1代进行自交，成功获得了 274 株F2单株群体，从 F2群体中随机选取了 188 株用作构建遗传图谱的个体。基于雷蒙德氏棉基因组开发的12560对gSSR引物，对亲本进行多态性筛选，获得994对多态性引物，多态率为7.9%。用这些多态性引物来检测（瑟伯氏棉D1-5×三裂棉D8-7）F2群体188个单株的基因型，最后共获得963个标记。 利用Joinmap 4.0作图软件构建的遗传连锁图谱共包括849个有效标记位点，覆盖全部13条染色体。其中标记最多的是Chr09染色体，有93个；标记最少的是Chr02染色体，有21个。该遗传图谱总长1012.458 cM，相邻两个标记间的平均距离是1.193 cM，有114个标记位点没有进入任何连锁群。经卡方检测，连锁图谱上存在134个偏分离标记，偏分离比例为15.8%。在全部的13条染色体中一共有8个SDR区域。其中Chr01、Chr02、Chr06、Chr09、Chr10、Chr11各有一个SDR，分别命名为SDR1、SDR2、SDR6、SDR9、SDR10、SDR11。Chr07上有两个SDR命名为SDR7-1、SDR7-2。 通过对瑟伯氏棉×三裂棉的遗传连锁图谱与已经基因组测序的雷蒙德氏棉基因组物理图谱对比，发现遗传图与物理图存在较好的线性关系，个别染色体上存在倒位（Chr02、Chr03、Chr05、Chr07、Chr13）和易位（Chr03、Chr08、Chr09）现象，呈非共线性关系。该遗传图对应到雷蒙德氏棉物理图谱0.707 Gb基因组大小。本次遗传连锁图的构建，为进一步解析二倍体野生棉基因组结构与功能、挖掘野生棉抗逆优良基因、比较基因组学的研究以及标记辅助选择育种等研究提供了一定的工作基础。
瑟伯氏棉;三裂棉;遗传连锁图;抗逆基因;选择育种
河南大学
硕士
植物学
刘方
2018
中文
S562
63
2018-12-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）