天然牛磺酸调控肝星状细胞基因组学和代谢组学的研究
目的： 肝星状细胞（HSC）参与肝纤维化、肝硬化、肝癌等多种肝病病理过程。前期研究发现天然牛磺酸具有促进HSC凋亡、抑制其增殖作用。本实验基于基因组学和代谢组学研究天然牛磺酸对HSC的调控作用，从基因、信号转导通路、代谢等不同方面对其机制进行分析，寻找具有治疗通路的位点，阐明天然牛磺酸对HSC调控的机制和靶点。 方法： 1、基因组学研究：提取总RNA，基因芯片检测，筛选出与天然牛磺酸作用相关的差异表达基因，并用荧光定量PCR对结果进行验证。然后对差异表达基因进行生物学功能分类、表达谱分析及分子调控路径分析，获得天然牛磺酸对HSC调控的作用机制和靶点。2、代谢组学研究：采用液相色谱-质谱联用（Liquid Chromatography-Mass Spectrometry, LC-MS）的代谢组学技术对HSC内源性代谢产物进行代谢谱检测，分析天然牛磺酸对HSC内源性代谢产物的影响；使用主成分分析（principal component analysis, PCA）和最小二乘判别分析（Projections to latent structures discriminant analysis, PLS-DA）找出变化最显著的代谢物，最后通过MetPA分析获得最有意义的代谢通路。 结果： 1、基因组学研究结果：经研究共获得差异基因1767个，其中上调的差异表达基因有732个，下调基因有1035个，上调最显著的10个差异表达基因是PILRB、RNU105C、HS.61151、CD177、PCDH7、LOC728760、HS.573552、HS.550248、FRAS1、SULT1A3，下调最显著的10个差异表达基因是EPS15、OPALIN、HS.225083、GUCA2A、LRP2、STRN、MMP21、GCSH、ALDH1L2及NBN。这些差异基因主要具有雌激素受体的活性、JUN激酶活性、蛋白酪氨酸激酶活性、异戊烯基转移酶活性的蛋白质、磷酸转移酶活性、醇基作为受体、N-甲基-D-天冬氨酸?选择性谷氨酸受体活性、蛋白激酶活性、内皮素受体活性、基转移酶活性、雌激素反应元件结合等分子功能；其中主要涉及的生物工程有多细胞有机体过程、糖代谢过程、NO合成酶合成的调控过程、细胞凋亡的调控过程、细胞程序性死亡的调节、发育过程等过程。 2、代谢组学研究结果：鞘脂类代谢、谷胱甘肽代谢、硫胺素代谢通路影响值大于0.10，提示PLS-DA所筛选出的差异代谢物与这几个代谢途径有显著的相关性，进一步说明天然牛磺酸对HSC的调控与这些通路有关。 结论： 1、天然牛磺酸调控HSC相关基因有1767个，其中上调的基因有732个，下调基因有1035个，上调最显著的有10个差异表达基因是PILRB、RNU105C、HS.61151、CD177、PCDH7、LOC728760、HS.573552、HS.550248、FRAS1、SULT1A3，下调最显著的10个差异表达基因是EPS15、OPALIN、HS.225083、GUCA2A、LRP2、STRN、MMP21、GCSH、ALDH1L2及NBN。 2、天然牛磺酸调控HSC可能涉及到多细胞有机体、糖代谢、NO合成酶合成的调控、细胞凋亡的调控、细胞程序性死亡、发育等过程。 3、天然牛磺酸对HSC的调控与鞘脂类代谢、谷胱甘肽代谢、硫胺素代谢通路有关。
肝纤维化;天然牛磺酸;肝星状细胞;细胞凋亡;调控机制
广西中医药大学
硕士
中西医结合临床
梁健
2017
中文
R575.2;R285.5
88
2019-03-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）