海南稻作区稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异监测与多样性分析
海南省地处热带.由于具有国内其他地区无可比拟的光温资源优势,每年有大量的水稻材料在南繁区繁育与种植,给稻瘟病菌的变异及传播带来了极大的便利.自20世纪70年代以来,Pik等位基因已被广泛地用作水稻抗稻瘟病育种的主要抗源.为了解海南稻瘟病菌AvrPik等位基因的变异及多样性,本研究从海南稻作区采集穗茎瘟病样,通过单孢分离获得100株稻瘟病菌株.利用AvrPik基因特异性引物扩增病原菌DNA,所得PCR产物经克隆、测序后与参考序列进行比对分析.结果从100株菌株中鉴定出AvrPik_A、AvrPik_B、AvrPik_D、AvrPik_E和AvrPik_F共5种等位基因类型.其中AvrPik_D类型最多,出现频率为50.00％;其次为AvrPik_E类型,出现频率为32.08％;第三为AvrPik_B类型,出现频率为8.49％.在AvrPik等位基因核苷酸多样性方面,非信号肽区域多样性要明显高于信号肽区域.就群体受到的选择压而言,南繁种植区与常规种植区的稻瘟病菌群体的Ka/Ks值均大于1,分别为2.703 1和1.236 6,表明,无论是南繁区还是常规种植区,AvrPik等位基因均受到了强烈的正选择压,且南繁区群体受到的选择压更强.上述5种不同基因型的代表菌株中菌株20MG48(AvrPik_F)长势最快,其产孢量却最少.本研究初步明确了海南稻作区AvrPik等位基因的群体结构,为本稻作区抗性品种的布局以及抗瘟育种计划提供参考.
稻瘟病菌、AvrPik等位基因、多样性
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S435.111.41(病虫害及其防治)
海南省重大科技计划zdkj201901
2023-04-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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