利用小RNA深度测序技术鉴定上海地区'红美人'柑橘病毒种类
为明确上海地区'红美人'柑橘的病毒种类,2020年4月在崇明、金山、奉贤、嘉定、闵行和浦东采集疑似病毒感染的叶片样品11份,采用小RNA深度测序技术结合RT-PCR对不同来源的混合样品进行病毒种类鉴定.结果 表明,样品中含有柑橘衰退病毒Citrus tristeza virus (CTV)、柑橘黄化脉明病毒Citrus yellow vein clearing virus(CYVCV)、柑橘树皮裂纹类病毒Citrus bark cracking viroid(CBCVd)和柑橘类病毒Ⅴ Citrus viroid Ⅴ(CVd-Ⅴ).同时发现,上海地区'红美人'柑橘病毒复合侵染现象普遍.基于CTV和CYVCV的CP全长基因及CBCVd和CVd-Ⅴ全基因组序列系统进化分析结果表明:除了CYVCV的分离物与地理来源具有明显的相关性外,其余病毒及类病毒均没有严格的地域相关性.研究结果为开展'红美人'柑橘种苗病毒检测及病毒病的防治奠定基础.
柑橘;小RNA深度测序;病毒鉴定
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S436.66(病虫害及其防治)
上海市农委科技兴农项目2019-02-08-00-16-F01126
2022-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
102-108,114
