10.11735/j.issn.1671-170X.2016.05.B014
基于调控网络探究丙肝肝硬化发展为肝癌的分子机制研究
[目的]探究丙肝肝硬化发展为肝癌的分子机制,为肝癌的早期诊断和治疗提供新思路.[方法]利用生物信息学手段,根据肝硬化和肝癌两种状态下基因间的相关系数变化寻找差异共表达基因,同时筛选甲基化基因,整合miRNA—靶点、转录因子—靶点的调控关系,构建miRNA—转录因子—基因的调控网络并进行拓扑学分析.[结果]确定了肝硬化和肝癌中包含miR-590-3p、TSG101、EGR1、MME在内的主要hub因子.与肝硬化相比,肝癌中的基因间相关系数总体呈下降趋势,hub因子相关的基因问也以相关系数降低为主.[结论]miRNA—转录因子—基因的调控网络可以系统地分析肝癌的分子机制,网络中的hub因子可以作为潜在的肿瘤标志物用于肝癌的早期诊断和治疗.
肝肿瘤、差异共表达、miRNA、转录因子、甲基化、调控网络
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R735.7(肿瘤学)
2016-08-02(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
403-409