10.3760/cma.j.issn.0254-6450.2020.02.019
无锡市2013-2016年HIV-1亚型及进化分析
目的 了解无锡市HIV-1亚型流行及进化特征,为预测本地HIV-1疫情变化提供参考依据.方法 样本来源于2013年4月至2016年7月无锡市部分CD4+T淋巴细胞监测队列,进行HW-1基因的扩增和测序,采用ChromasPro 1.6和MEGA 7.0软件构建HIV-1序列数据库;采用FastTree 2.1.10和BEAST 1.7.2软件和贝叶斯系统进化推断法重构HIV-1历史传播情况,采用SPSS 22.0软件进行统计学分析.结果 有205例HIV-1感染者,其中≥50岁占32.68％(67/205).共检测出CRF01_AE、CRF07_BC、CRF67_01B、B、CRF08_BC、CRF68_0B、CRF78_ cpx7种HW-1基因型及1例独特重组型.流行亚型以CRF01_ AE(51.67％,93/180)及CRF07 BC(17.22％,31/180)为主,不同亚型之间传播方式的差异有统计学意义(x2=16.99,P≤0.05).CRF67_ 01B型(12.78％,23/180)所占比例较高.贝叶斯系统进化推断法分析结果显示,无锡市CRF67_ 01B型进化率为2.29×10-3,最近共同祖先时间约为2 003.10年,与江苏省及安徽省来源的参考株可能存在亲缘关系,CRF67 01B型于2003年开始在无锡市出现传播.结论 2013-2016年无锡市HIV-1亚型复杂多样,CRF67 01B型已经开始在无锡市流行,应持续监测HIV-1亚型变化,从分子角度为疫情预测提供参考依据.
HIV-1型、亚型、进化
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中央高校基本科研业务费专项资金2242016K40025;江苏省研究生科研与实践创新计划KYCX17_0184Fundamental Research Funds for the Central Universities2242016K40025;Postgraduate Research and Practice Innovation Program of Jiangsu ProvinceKYCX17_0184
2020-04-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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