10.3969/j.issn.1672-2922.2017.01.018
小鼠急性未分型流感嗜血杆菌中耳炎差异基因的互作网络特征分析
目的利用基因表达数据库(GEO)查找小鼠中耳炎表达谱基因芯片原始数据,建立中耳炎基因互作网络图.方法从公共数据库GEO中下载小鼠中耳炎相关数据集,采用Affymetrix Expression Console软件和Tran?scriptome Analysis Console(TAC)软件筛选差异表达基因,将差异基因导入STRING在线数据库进行分析,绘制差异基因互作网络图,并将互作网络数据导入Cytoscape 3.4.0软件中,筛选网络中心节点,并取其中相对独立、作用较为集中且与炎症基因相关子网络,采用David在线工具对其进行功能注释富集分析.结果共筛选出1166个差异表达基因,其中表达上调793个,表达下调373个,经STRING在线工具筛选后共有459个小鼠中耳炎差异基因编码的蛋白存在相互作用,并得到相应蛋白互作网络,分析其中与炎症相关子网络.结论本研究利用生物信息学技术构建了中耳炎差异基因互作网络,其中的网络中心节点基因,对于中耳炎分子机制研究及靶向治疗具有指导作用.
未分型流感嗜血杆菌、中耳炎、基因芯片、互作网络
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R764.21(耳鼻咽喉科学)
国家自然科学基金csfc81373151;重庆市自然科学基金cstc2012jjA10014;重庆市教委科学技术研究项目KJ130313;国家临床重点专科建设项目经费基金资助卫办医政函[2012]649号This work was supported by the National Natural Science Foundation of Chinacsfc81373151;supported by the Nation-al Natural Science Foundation of Chinacstc2012jjA10014;supported by the Project Foundation of Chongqing Municipal Education CommitteeKJ130313;supported by National Key Clinical Specialties Construction Program of china
2017-04-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共5页
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