10.3760/cma.j.cn311365-20221220-00505
宏基因组学二代测序在艾滋病合并肺部感染患者中的临床应用
目的:了解本地区艾滋病患者合并肺部机会性感染的病原谱，并评价宏基因组学二代测序(mNGS)在艾滋病合并肺部感染患者中的临床应用。方法:以2021年1月至12月在武汉大学中南医院住院的艾滋病合并肺部感染患者为研究对象，对其支气管肺泡灌洗液(BALF)进行mNGS和常规病原学检测。常规病原学检测方法包括涂片、培养、聚合酶链反应(PCR)和免疫层析胶体金法。统计学方法采用Fisher确切概率法。结果:共纳入69例患者，其mNGS检测结果均为阳性，其中真菌和病毒各检测出53例次(76.8%)，细菌[不包括结核分枝杆菌(MTB)和非结核分枝杆菌(NTM)]40例次(58.0%)，MTB 6例次，NTM 11例次，其他7例次；89.9%(62/69)的患者为2种或以上病原体的混合感染。BALF的常规病原学检测中，79.7%(55/69)的患者检出病原体阳性，包括耶氏肺孢子菌聚合酶链反应(PCR)检测阳性42例次，BALF培养阳性16例次，MTB PCR检测阳性9例次，隐球菌抗原阳性5例次。mNGS总检出率为100.0%(69/69)，高于常规病原学检测的79.7%(55/69)，差异有统计学意义(Fisher确切概率法，
P<0.001)。mNGS检测特异度为88.4%。结合临床及2种检测方法，前5位的病原体分别为耶氏肺孢子菌[62.3%(43/69)]、念珠菌[29.0%(20/69)]、MTB[20.3%(14/69)]、NTM和马尔尼菲篮状菌[各15.9%(11/69)]。76.8%(53/69)的患者合并病毒感染。
结论:本地区艾滋病患者合并肺部感染的病因以混合感染为主，耶氏肺孢子菌为最常见的病原体。mNGS可提高艾滋病合并肺部感染患者的病原体检出率。
获得性免疫缺陷综合征、HIV、宏基因组学二代测序、病原学检测、肺部感染、疾病谱
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R512.91(传染病)
湖北省重点研发计划项目2020BCB025;武汉大学中南医院学科培育项目ZNXKPY2021021;Hubei Province Key Research and Development Project2020BCB025;Discipline Cultivation Funding, Zhongnan Hospital of Wuhan UniversityZNXKPY2021021
2024-01-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共7页
507-513
