10.3760/cma.j.cn311365-20200108-00007
厦门地区G9型A组轮状病毒 VP7基因序列特征的分析
目的:了解厦门地区G9型A组轮状病毒主要中和抗原VP7的编码基因进化遗传变异与国内外部分地区
VP7基因的差异。
方法:4株G9型A组轮状病毒毒株来自厦门市儿童医院腹泻患儿的粪便样本，采集时间分别为2017年10月5日、2017年11月12日、2017年12月7日和2018年1月15日。采用反转录聚合酶链反应检测G9型A组轮状病毒
VP7的基因全长序列，并用DNA Star、MEGA等生物学软件对测序后获得的基因序列进行同源性分析、系统进化分析，以及氨基酸序列比对。
结果:进化树分析显示，厦门地区Amoy CHINA/2018地方株与成都市human/SC7/CHN/2013/G9地方株联系最为密切，与江苏省Hu/JS2016地方株同源性较远。氨基酸序列比对分析显示，与参考株WI61相比，厦门地方株在氨基酸一级结构上存在变异，包括D100N、Y144H，这两个位点是进化树Amoy CHINA/2018簇内的代表性变异位点。结论:G9型A组轮状病毒
VP7的基因组全长序列显示该病毒株在我国存在进化变异。
序列分析、A组轮状病毒、G9型、VP7
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R511(传染病)
厦门市科技惠民计划项目3502Z20164072;厦门市儿童医院骨干人才培育项目CHP-2019-BT-A006;Xiamen Science and Technology Benefit the People Project3502Z20164072;Key Talents Cultivation Project of Xiamen Children′s HospitalCHP-2019-BT-A006
2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共4页
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