10.3760/cma.j.cn311365-20200328-00416
2019新型冠状病毒刺突蛋白表位预测及变异分析
目的:预测2019新型冠状病毒(2019 novel coronavirus，2019-nCoV)刺突蛋白的抗原表位，分析刺突蛋白的变异规律。方法:从基因库(GenBank)和全球共享禽流感数据倡议组织数据库下载2019-nCoV的基因序列(截至2020年3月4日)。应用ClustalW、MEGA 7.0、免疫表位数据库等生物信息学软件，预测刺突蛋白潜在的B淋巴细胞和T淋巴细胞表位，分析比较刺突蛋白的变异在表位区与非表位区的特点。统计学分析采用
χ2检验。
结果:刺突蛋白有130个潜在表位，包括25个线性B淋巴细胞表位、18个非线性B淋巴细胞表位、71个人类白细胞抗原(human leukocyte antigen，HLA)Ⅰ类限制性T淋巴细胞表位和16个HLA Ⅱ类限制性T淋巴细胞表位。S
404-426肽段有较高的抗原性，且在中国的人群覆盖率达73.4%。与1月31日之前的2019-nCoV刺突蛋白相比，其在1月31日之后的变异频率在非表位区(15.4%比21.7%)和表位区(6.2%比8.7%)都有所增加，但差异均无统计学意义(均
P>0.05)。
结论:2019-nCoV刺突蛋白有多个抗原表位，为2019-nCoV疫苗的研究提供了参考依据。刺突蛋白的变异有增加趋势，需进一步关注和研究。
冠状病毒、2019新型冠状病毒、表位、突变
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R512.99(传染病)
2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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