10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2018.02.007
广东省人类免疫缺陷病毒-1CRF07_BC毒株gag-pol基因特征和原发耐药突变分析
目的 了解广东省HIV-1 CRF07_BC病毒株gag-pol基因的遗传变异特征.方法 收集广州市第八人民医院2015年2月至9月78例CRF07_BC基因亚型HIV感染者抗病毒治疗前血浆,提取病毒RNA,反转录套式PCR扩增并拼接获得病毒gag和pol区基因序列.对获得的序列进行进化树、基因离散率、核苷酸多态性、选择压力和变异特征分析.结果 人群主要传播途径为同性传播(80.77％,63/78),gag-pol基因进化树分成两个亚簇,不同传播途径毒株没有完全成簇聚集.gag基因平均基因离散率及平均熵值均大于pol基因.gag基因的p17区和p6区的平均基因离散率及平均熵值均大于p24区;pol基因的pr区平均基因离散率及平均熵值均大于rt区.gag和pol基因的平均ds/dn值均＞1.将GAG区共享序列与选取的我国常见HIV相关抗原表位(A2、A11、B39、B60两个、Cw1、Cw3、Cw8)比较,发现P17区CTL抗原表位突变多于P24区CTL抗原表位.表位保守率分别为26.92％、0、1.28％、0、96.15％、82.05％、84.62％和98.72％.对pol区基因序列进行HIV耐药性分析,耐药突变发生率为2.56％(2/78).结论 广东省CRF07_BC毒株的gag和pol基因均发生突变.gag基因变异度大于pol基因,且gag基因的变异主要体现在p17和p6区;gag和pol基因均受负向选择压力;P17蛋白CTL抗原表位变异度大于P24蛋白抗原表位;耐药突变发生率低于警戒线,可以继续监测耐药毒株传播情况.
HIV-1、流行病学、分子、CRF07_BC、耐药突变
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广东省科技计划项目2016A020215008,2016B020238002,2014A020212425;广州市科技计划项目健康医疗协同创新重大专项158100064Science and Technology Planning Project of Guangdong Province2016A020215008,2016B020238002,2014A020212425;Guangzhou Science and Technology Planning Project158100064
2018-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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