10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2016.07.004
广东地区甲型H3N2流行性感冒病毒毒株血凝素基因变异与进化对抗原表位的影响
目的 揭示2014年至2015年广东地区流行性感冒(流感)H3N2病毒血凝素(HA)基因进化特征及抗原表位变异.方法 采用时空抽样法抽样,检测2014年至2015年广东省分离的17株流感H3N2病毒HA基因核苷酸序列,下载GenBank中36株参考基因序列;比对HA基因核苷酸序列,分析基因氨基酸变异,构建遗传进化树和熵值图;同时分析2014年至2015年广东毒株HA基因的抗原表位变异和选择性.结果 以疫苗株A/Texas/50/2012毒株HA基因为基准,2014年至2015年广东地区17株流感毒株HA基因共有25个位点氨基酸置换;HA1基因表位A、B、D和E发生变异,涉及11个氨基酸位点;毒株A/Guangdong/55/2015的HA基因出现N38K变异,减少1个糖基化位点.高突变位点为175位(熵值为1.16);综合评价单似然祖先计数(SLAC)、固定效应似然比(FEL)和内部固定效应似然比(IFEL)模型筛选结果,可能正向选择位点包括位点363,负向选择位点包括位点368和425.结论 广东省流感H3N2病毒HA基因表位A、B、D和E发生变异,进化正向选择位点包括位点363,负向选择位点包括位点368和425;变异累积可能导致流感H3N2病毒疫情流行.
H3N2毒株、血凝素类、突变、进化、表位
34
R373.13;S852.65;R511.7
2016-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
404-409
