10.3760/cma.j.issn.1000-6680.2012.11.002
艾滋病患者马尔尼菲青霉菌rDNA转录间隔区序列分析
目的 了解广东省和广西地区AIDS患者马尔尼菲青霉菌(PM)分离株rDNA转录间隔区(ITS)序列的特征和变异.方法 AIDS患者PM分离株15株,其中12株来源于广东,3株来源于广西.运用真菌核糖体通用引物ITS1和ITS4,对其rDNA ITS进行扩增和测序,测序结果在GenBank核酸序列数据库中进行同源序列搜索,构建NJ系统树.结果 15株PM分离株rDNAITS序列长度为578 bp,包括18S rRNA、ITS1、5.8S rRNA、ITS2及28S rRNA,与来源于日本和泰国的PM的rDNA ITS序列一致性高达97％～100％,同源性100％;11株广东来源PM和1株广西来源PM菌株rDNA ITS序列完全相同,1株广东来源PM和2株广西来源PM菌株的rDNA ITS序列存在1个碱基差异；分子进化树显示,PM与毛霉菌、稻根霉菌rDNA ITS序列的遗传距离最远,与支顶孢菌、组织胞浆菌及青霉属其他菌种如嗜松青霉、棘孢青霉的rDNA ITS序列的种间遗传距离较小.结论 广东和广西地区AIDS患者PM分离株的rDNA ITS序列非常保守,可作为靶基因来设计PM的种特异性引物,用于菌种鉴定.
马尔尼菲青霉菌、DNA,核糖体、序列分析、获得性免疫缺陷综合征
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广东省自然基金资助项目10151006002000000
2013-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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