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10.3760/j.issn:1000-6680.2007.03.005

广西狂犬病野毒株N基因的测序与分析

引用
目的 对广西狂犬病野毒株N基因进行测序和分析,了解其遗传特点和进化规律.方法 2003至2004年从广西各地采集595份动物脑材料,经RT-PCR法确定16份为阳性.对此16株狂犬病野毒株N基因全序列进行RT-PCR扩增、克隆和测序分析.结果 广西狂犬病病毒株属于Ⅰ型,可分为Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ群.GX01、GX08、GX09、GX014、GX091、GX195、GX260、GXLA、GXHX和GXSL株的同源性在97.6%~99.8%,为Ⅰ群,它们与其他毒株的同源性为89.0%~89.7%;GX219、GX074、GX304、GXBM和GXPX株的核苷酸同源性在98.4%~99.9%,为Ⅱ群,它们与其他各株的同源性为88.6%~89.7%;GXN119株为Ⅲ群,与泰国的8738THA株核苷酸同源性为95.3%.遗传进化分析表明,389位磷酸化位点、主要的4个抗原区及Th细胞表位区非常保守.N蛋白上的氨基酸变异主要集中在42、90、110、128、135、332、379和397位氨基酸上,这些氨基酸的变异与同源性分群结果一致.结论 根据基因同源性、遗传进化树及氨基酸变异分析,广西狂犬病野毒株分3群,呈地区性分布.

狂犬病病毒、核蛋白类、序列分析、逆转录聚合酶链反应、基因扩增

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R3(基础医学)

教育部留学回国人员科研启动基金教外司留[1998]679号

2008-03-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

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2007,25(3)

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