10.3760/j.issn:1000-6680.2006.05.007
丙型肝炎病毒F反式调节靶基因反式激活基因的筛选和生物信息学分析
目的 构建丙型肝炎病毒(HCV)F反式调节靶基因FTP2的反式激活基因的cDNA文库,克隆FTP2反式激活基因.方法 以HCV FTP2表达质粒pcDNA3.1(-)-HCV FTP2转染HepG2细胞,以空载体pcDNA3.1(-)为对照;制备转染后的细胞裂解液,从中提取mRNA并合成cDNA,经Rsa Ⅰ酶切后将实验组cDNA分成两组,分别与两种不同的接头衔接,再与对照组cDNA进行两次消减杂交及两次抑制性聚合酶链反应(PCR),将产物与T/A载体连接,构建cDNA消减文库,并转染大肠埃希菌进行文库扩增,随机挑选克隆PCR后进行测序及同源性分析.结果 成功构建人HCV FTP2反式激活相关基因差异表达的cDNA.扩增后得到56个200~1000 bp插入片段的克隆,随机挑选其中24个插入片段测序,并通过生物信息学分析获得其全长基因序列,结果共获得20种编码基因,其中1个为未知功能的新基因.结论 筛选到的cDNA全长序列,包括一些与细胞生长调节、物质代谢和细胞凋亡密切相关的蛋白编码基因.
肝炎病毒、FTP2、反式激活(遗传学)、杂交、遗传、克隆、分子、F蛋白
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R5(内科学)
国家自然科学基金C30371288
2006-12-04(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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