10.19802/j.issn.1007-9084.2020043
向日葵锈病抗性相关microRNA的挖掘及其靶基因预测
前期利用高通量测序技术及生物信息学分析方法,在向日葵上预测筛选到10个差异表达的新microRNA(miRNA)可能与锈病抗性相关.本试验利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术,对筛选到的10个miRNA做进一步的定量验证.结果 表明,相比于水处理的健康叶片(对照组A),接种锈菌300生理小种的叶片中(抗病组B)Han-miR21、Han-miR25、Han-miR42表达量呈上调趋势,Han-miR11、Han-miR34、Han-miR43、Han-miR47、Han-miR67表达量呈下调趋势;接种锈菌737生理小种的叶片中(感病组C)Han-miR25、Han-miR42的表达量呈上调趋势,Han-miR11、Han-miR21、Han-miR34、Han-miR43、Han-miR47、Han-miR67表达量呈下调趋势.qRT-PCR的检测结果与前期高通量测序结果80％相一致.利用miRanda软件预测靶基因,10个miRNA共预测到117个靶基因,其中86个靶基因获得其生物信息学功能注释.运用miRBase数据库,对10个新预测miRNA进行同源性分析发现,新预测的10个miRNA与拟南芥、烟草、水稻等作物中参与病害逆境胁迫响应的miRNA有较高相似性(62％～100％).定量检测和验证miRNA作用的靶基因时发现,抗病组表达量上调的Han-miR21对应的靶基因有1个下调、表达量下调的Han-miR43对应的靶基因有3个上调,符合miRNA与其靶基因互作的规律.
向日葵锈病、抗锈相关miRNA、靶基因预测、qRT-PCR
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S432.2;S435.655(病虫害及其防治)
国家自然科学基金31760509
2020-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共14页
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