斑点叉尾 ipu-miR-143靶基因EB1的鉴定
采用生物信息学方法对斑点叉尾(Ictalurus punctatus)ipu-miR-143的靶基因进行预测，并对预测到的ipu-miR-143靶基因进行生物学鉴定。生物信息学预测结果显示，斑点叉尾微管相关蛋白基因RP/EB家族EB1基因的3′-UTR区具有ipu-miR-143的潜在作用位点。结合对几种近缘物种中RP/EB家族EB1基因和miR-143的进化保守性进行分析，推测ipu-miR-143在斑点叉尾中可以通过靶向EB1基因的3′-UTR区而发挥其调控功能。因此，本研究将斑点叉尾 EB1基因的3′-UTR区(含有miR-143靶位点)构建到pMIR-REPORTTM Luciferase载体的下游，通过双荧光素酶报告基因检测系统对ipu-miR-143的靶基因进行鉴定。采用HEK293和CCK两种细胞进行细胞转染，两种细胞中转染 miR-143 mimics 组荧光相对活性与对照组相比均表现为显著性降低(P<0.05)。共转染miR-143 inhibitors 后， CCK 细胞中荧光素酶相对活性(8.27±1.02)与对照组相比(5.44±1.55)显著上调(P<0.05)；HEK293细胞中荧光素酶相对活性(6.30±1.19)与对照组(4.26±0.84)相比有所上升，但无显著性差异(P>0.05)。初步研究结果提示， miR-143可以通过靶向EB1基因的3′-UTR区而发挥其调控功能。本研究旨为后续深入研究斑点叉尾 EB1基因的转录后调控机制提供基础依据。
斑点叉尾、miR-143、EB1基因、靶基因
S96(水产养殖技术)
江苏省自然科学基金面上研究项目BK2011864
2014-03-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
283-290
