传染性造血器官坏死病毒-Sn1203株的基因型及糖蛋白的生物信息学分析
利用鲤(Cyprinus carpio)上皮细胞(epitheliaoma papulosum cyprini, EPC)培养传染性造血器官坏死病毒-Sn1203分离株(IHNV-Sn1203),根据GenBank中IHNV G蛋白基因开放阅读框(open reading frame, ORF)的序列设计引物(GenBank序列编号AB288207),采用RT-PCR的方法克隆得到IHNV-Sn1203株G蛋白全长ORF,克隆至表达载体pET27b(+)中,构建了pET27-G重组质粒,并进行了测序分析。生物信息学分析结果显示, IHNV-Sn1203株G蛋白基因序列长度为1527 bp,与韩国株具有最高的核酸同源性(96.86%)和氨基酸同源性(97.05%)。该基因编码508个氨基酸残基,推导分子量约为56.55 kD,等电点为6.15；氨基酸序列分析表明, G蛋白富含丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸,存在28个潜在的磷酸化位点；存在4个潜在的N-糖基化位点和7个潜在的O-糖基化位点；G蛋白N端含有20个氨基酸的信号肽；亲水性大于输水性；位于483~508位氨基酸存在一跨膜区；抗原表位预测显示抗原性良好；系统进化树分析显示, IHNV-Sn1203株与日本株和韩国株聚为一簇,都属于JRt基因型。
传染性造血器官坏死病毒、糖蛋白、生物信息学分析、IHNV基因型
Q785;S917(基因工程（遗传工程）)
国家科技支撑计划2012BAD25B10;中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目HSY201204
2014-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
180-188
