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10.3321/j.issn:1005-8737.2005.05.010

中国大菱鲆虹彩病毒主要衣壳蛋白基因的PCR扩增及序列分析

引用
应用同源PCR技术,从被一种球状病毒感染的患病大菱鲆(Scophthalmus maximus)脾脏和肾脏组织中扩增出了一段长度为620 bp的DNA片断.序列测定和Blast分析表明,该DNA片断与鱼类虹彩病毒主要衣壳蛋白(MCP)C末端编码区的DNA序列高度相似,由此证实感染养殖大菱鲆的这种球状病毒为一种鱼类虹彩病毒,暂命名为大菱鲆红体病虹彩病毒(TRBIV).多序列比对和分析发现,TRBIV MCP C末端的205个氨基酸序列与GenBank中20种虹彩病毒相应序列的相似性分别为99.47%(韩国大菱鲆虹彩病毒)、97%~98%(待指定病毒属的7种病毒),以及50%以下(蛙病毒属、淋巴囊肿病毒属、虹彩病毒属的12种病毒),由此绘制出了包含TRBIV在内的21种虹彩病毒的系统发育树.研究结果表明,感染中国养殖大菱鲆的TRBIV属于虹彩病毒科待指定病毒属,位于该属ISKNV亚群和RSIV亚群之间,是该病毒属的一个新成员.

大菱鲆、虹彩病毒、主要衣壳蛋白基因、聚合酶链反应、序列分析

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S941.41(水产保护学)

国家高技术研究发展计划863计划2003AA622070;国家自然科学基金30471338

2005-11-03(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

共6页

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中国水产科学

1005-8737

11-3446/S

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2005,12(5)

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