10.3969/j.issn.1000-484X.2023.07.007
基于生物信息学分析腹膜透析腹膜细胞的免疫相关基因差异表达
目的:应用生物信息学方法分析不同腹膜透析时间的腹膜细胞的免疫相关基因(IRGs)表达差异,探索参与腹膜损伤、腹膜纤维化的重要生物标志物.方法:下载基因芯片数据集GSE125498,利用GEO2R数据库分析平台筛选差异表达基因.从ImmPortPortal数据库下载IRGs列表,并筛选出差异表达的IRGs.应用DAVID、STRING生物信息学分析平台,及Cytoscape软件对筛选所得的差异表达IRGs进行生物学注释(GO)、信号通路富集分析(KEGG)及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析.结果:与20例短期腹膜透析患者相比,在13例长期腹膜透析患者中筛选出差异表达IRGs 36个(|log2FC|>1.0,校正后P<0.05),其中35个上调基因,1个下调基因.GO分析结果显示差异表达IRG的生物学过程主要富集在免疫应答,细胞学组分主要定位于质膜,子功能主要富集在跨膜信号受体活性,KEGG信号通路主要富集在细胞因子-细胞因子受体的相互作用.在PPI网络中应用MCODE及cytohHubba模块筛选出的关键基因为CCR7、CD40LG、IL7R.结论:随着腹膜透析时间的延长,腹膜细胞的免疫应答活跃,相关基因CCR7、CD40LG、IL7R可能是腹损伤、纤维化形成的重要的免疫学标志物.
腹膜透析、免疫相关基因、差异表达
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R692.5(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)
汕头市科技计划医疗卫生类别项目;汕头市中心医院科研培育计划资助项目
2023-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共4页
1379-1382
