10.3969/j.issn.1000-484X.2021.10.011
脂多糖结合蛋白在胃癌组织中的表达及其意义的生物信息学分析
目的:通过生物信息学方法分析脂多糖结合蛋白(LBP)在胃癌组织中的表达及意义.方法:从Ualcan数据库获取正常胃组织及胃癌组织LBP表达数据,利用GEPIA数据库分析LBP表达与胃癌患者预后的关系,在LinkedOmics中检索LBP在胃癌中的共表达基因,通过GO富集分析、KEGG通路分析确定这些基因参与的生物学过程及功能.最后利用STRING数据库分析相关基因编码蛋白的互作网络.结果:与正常胃组织相比,Ⅰ和Ⅲ分期、老年和男性患者胃癌组织中LBP表达水平均明显升高,但与幽门螺杆菌感染与否无显著相关性.在胃癌中与LBP共表达的基因主要涉及急性炎症反应、激活蛋白级联、蛋白质-脂质复合物亚基组织等生物学过程,介导货物受体活性、脂多糖结合、蛋白质-脂质复合物的绑定、糖胺聚糖绑定等分子功能,富集于血液微粒、蛋白质-脂质复合物、内质网腔等细胞组分.富集的KEGG信号通路主要与补体和凝血级联、胆固醇代谢、PPAR信号等通路相关.LBP高表达患者的总生存率和无病生存率明显低于LBP低表达患者.LBP蛋白与TLR4、STAT3、IL-6、STAT6、IL-4、IL-10、JAK1、JAK2、JAK3、SOCS3等存在互作关系.结论:LBP在胃癌组织中高表达,且与胃癌的发生、发展及预后密切相关,可以作为胃癌筛选、预后预测的标志物之一.
胃癌、脂多糖结合蛋白、生物信息学分析、共表达分析
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R735.2(肿瘤学)
国家自然科学基金;博士启动基金
2021-07-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
1201-1209
