10.3969/j.issn.1000-484X.2012.01.013
苹果过敏原Mal d4蛋白抗原表位预测及交叉反应分析
目的:预测苹果过敏原Mal d 4蛋白B细胞和T细胞抗原表位,探讨Mal d 4蛋白与其同源蛋白之间的交叉反应性.方法:以苹果过敏原Mal d 4蛋白的氨基酸序列为基础,采用生物信息软件HNN预测二级结构;运用DNAStar和Bcepred软件预测其B细胞抗原表位,用NetMHCⅡ、NetMHCⅡpan、Syfpeithi及Propred软件综合预测T细胞抗原表位;采用Clustal X1.83、Swiss-Model软件比对同源序列和模拟空间构象.结果:该蛋白二级结构以无规则卷曲为主.B/T细胞共同抗原表位的区域为53~61、85~93.苹果Mal d 4蛋白与桃、芒果、甜樱桃、草莓中的前纤维蛋白氨基酸序列同源性达88%以上,空间构象相似.结论:苹果过敏原Mal d 4蛋白与桃、芒果、甜樱桃和草莓的前纤维蛋白之间可能存在交叉反应,其优势抗原表位区域可能为53~61、85~93,是后续过敏原改造的重点,为继续深入开展苹果过敏原基础性研究提供理论依据.
苹果过敏原、Mal d 4、抗原表位、交叉反应、预测
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R392.8
国家科技重大专项重大课题2008ZX08011-005;重点课题2009ZX08011-004B;国家自然科学基金30771240;呼吸疾病国家重点实验室广州医学院课题研究基金
2012-02-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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