10.3969/j.issn.2095-2783.2018.12.014
金钱鱼线粒体基因的SNP检测分析
通过Hi-seq 2000高通量测序(high throughput sequencing,Hi-seq)获得金钱鱼的转录组数据,利用获得的转录组数据进行金钱鱼线粒体基因单核苷酸多态性(single-nucleotide polymorphism,SNP)的鉴定和分析.根据生物信息学的应用方法,对RNA-seq数据进行分析和筛选,得到金钱鱼线粒体基因组90个位点上的93个SNP.其中,在9个蛋白编码基因(ND1、ND2、COⅡ、ATP6、ND4L、ND4、ND5、ND6、Cytb)上均有SNP位点,而基因COⅠ、COⅢ和ATP8上未有检测到,并且蛋白编码基因上有5个SNP为非同义突变.本研究对SNP的测定和分析将为金钱鱼亲缘地理学和母系遗传进化等研究引入新的见解.
生物信息学、金钱鱼、高通量测序、线粒体基因组、单核苷酸多态性
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P735;Q7(海洋基础科学)
高等学校博士学科点专项科研基金资助项目20133104110004;科技部“中国—东盟海水养殖中心”重大国际合作项目
2018-12-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
1390-1395
