10.3969/j.issn.2095-2783.2015.02.014
基于信息增益理论的整体基因中基因互作挖掘方法
复杂疾病一般由多个基因共同作用发生,单个基因的效应微小,为了更好地研究基因互作对复杂疾病的影响,提出了一种基于基因的信息增益模型.信息增益在分类系统中指变量为分类带来信息的多少,带来的信息越多,该变量对分类越重要.该模型从一个整体基因的所有单核苷酸多态性位点(single nucleotide polymorphism,SNP)出发,采用病例-对照数据来检测基因互作对疾病的影响.由于基因是功能表达的最小单位,与基于SNP的交互作用分析方法相比,该模型更能从生物学的角度解释疾病的遗传机制.最后,采用模拟数据和类风湿性关节炎疾病的真实数据进行实验,并与基于SNP的熵模型以及基于基因的核典型相关分析模型(kernel canonical corelation based U statistic,KCCU)两种模型比较,结果均验证了该模型的有效性.
复杂疾病、基因互作、整体基因、信息增益
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TP3-05(计算技术、计算机技术)
国家自然科学基金资助项目61172098,61271346,91335112;高等学校博士学科点专项科研基金资助项目20112302110040;中央高校基本科研业务费专项资金资助项目HIT.KISTP.201418
2015-05-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
186-191
