10.12140/j.issn.1000-7423.2023.04.002
云南省输入性间日疟原虫多药抗性蛋白1基因突变多态性分析
目的 分析云南省输入性间日疟原虫的多药抗性蛋白1基因(Pvmdr1)突变多态性.方法 对云南省2020年和2021年诊断为间日疟原虫感染的病例血样进行Pvmdr1全基因扩增及测序,以间日疟原虫Sal-Ⅰ分离株的序列(GenBank登录号:NC_009915.1)为模板设计PCR反应引物,用MEGA 5.04软件与编码区参比序列(GenBank登录号:XM_001613678.1)进行比对,用DnaSP 6.11.01软件分析单倍型和单核苷酸多态(SNP)位点及其突变类型,并计算核酸多样性指数π、单倍型期望杂合度(He)等,用Network 10.0软件构建中介网络进化图.结果 共收集276份输入性间日疟患者血样,其中自缅甸感染病例占99.3％(274/276),自非洲、巴基斯坦感染各占0.4％(1/276).259份血样扩增获得4 392 bp的Pvmdr1全基因序列,提交GenBank获得的登录号为OP559204～OP559462.259条DNA序列π、Ka/Ks比值分别为0.000 76和3.600 6,共检出22个SNP,包括13个非同义突变和9个同义突变.仅c.4074C＞T位点突变在2020、2021年的检出率[15.0％(21/140)、5.9％(7/119)]差异有统计学意义(x2=5.546,P＜0.05).次等位位点为c.1587A＞G(97.9％,253/259),新检出 SNP 包括 c.2499G＞T(2.3％,6/259)、c.3358C＞T(0.4％,1/259)、c.3832C＞T(0.4％,1/259).c.3064C＞T、c.4065A＞G、c.3358C＞T 和 c.3832C＞T 突变位点仅在 2021 年的患者血样中检出,其中前2个SNP从非洲感染的分离株中检出,后2个SNP从缅甸感染的分离株中检出.259条Pvmdr1完整编码区与参比序列(单倍型Hap_1)比对,识别出26种单倍型(Hap_2～Hap_27),均为参比序列(单倍型Hap_1)的突变型,He为0.890 7.其中,Hap_8的检出率最高(18.5％,48/259),非洲感染分离株中仅检出Hap_19.2020、2021年的患者血样中检出的单倍型种类分别有15和22种,当年独有的单倍型分别为4和10种.Hap_10在2020、2021年患者血样中的检出率分别为15.0％(21/140)和3.4％(4/119),差异有统计学意义(x2=22.264,P＜0.05).不同单倍型的多重突变识别结果显示,4重、5重、6重、7重、9重、10重突变在26种单倍型中的占比分别为 0.4％(1/26)、19.2％(5/26)、38.5％(10/26)、30.8％(8/26)、0.4％(1/26)、0.4％(1/26).中介网络图显示,26种单倍型以单倍型Hap_1为起始,经4重突变(Hap_24),向5重、6重、7重、9重和10重突变逐级进化并远离起始点.结论 云南省输入性间日原虫Pvmdr1基因突变存在高度多态性.
间日疟原虫、多药抗性蛋白1、突变、云南省
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R382.311(医学寄生虫学)
2023-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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