棘球蚴AgB抗原家族基因的克隆及抗原表位的预测分析
目的 对棘球蚴AgB抗原家族的不同亚单位基因进行克隆,并对序列进行生物信息学分析和抗原表位预测分析.方法 根据GenBank中的参考序列设计特异性引物,以我国新疆、甘肃和四川来源的细粒棘球蚴(Eg)和多房棘球蚴(Em)虫体DNA为模板扩增目的基因,将PCR产物克隆到TA载体中测序.用Bioedit分析软件和Blastn、NPS@和IEDB等在线分析系统对序列进行分析.结果 分别从细粒棘球蚴和多房棘球蚴中克隆获得AgB抗原的全部5个亚单位基因,经测序确定为正确的目的序列;序列比对分析表明,EmAgB的5个亚单位基因序列高度保守,而EgAgB的亚单位基因变异性较大.细粒棘球蚴和多房棘球蚴种间差异分析显示,相同亚单位基因的序列一致性为87.69%～100%.AgB各亚单位抗原主要的二级结构包括α-螺旋、β-折叠和无规卷曲等3个类型.其中,AgB1、AgB2和AgB4等3个亚单位抗原中无规卷曲所占比例较高.AgB各亚单位抗原预测表位区共10个,分别是AgB1:1～7和21～27,AgB2:1～7和29～36,AgB3:1～11和18～28,AgB4:1～13、27～37和39～60,AgB5:1～11.结论 EgAgB和EmAgB亚单位抗原表位区的大部分序列一致或相似,预测的10个表位区主要位于序列N端.在5个亚单位抗原中,AgB1、AgB2和AgB4的抗原性较高.
细粒棘球蚴、多房棘球蚴、AgB基因家族、抗原亚单位、基因克隆、表位预测
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R383.33(医学寄生虫学)
国家自然科学基金30872211
2011-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
368-371,376
